稀疏型微生物組數(shù)據(jù)與表型的關(guān)聯(lián)分析(文獻)

A powerful microbial group association test based on the higher criticism analysis for sparse microbial association signals

一種基于更嚴格的稀疏微生物關(guān)聯(lián)信號的高效微生物群關(guān)聯(lián)檢驗方法

doi:10.1186/s40168-020-00834-9

Microbiome IF:14.65

推薦理由:

本文提出了一種新型算法MiHC有效改善微生物組數(shù)據(jù)與表型的關(guān)聯(lián)結(jié)果,該軟件采用R語言編寫江兢,可訪問 https://github.com/hk1785/MiHC 安裝臼婆。

主要結(jié)論:

①微生物組數(shù)據(jù)種系相關(guān)及高稀疏性導(dǎo)致微生物之間的相關(guān)性不準確,因此飒责,開發(fā)出一種可解決種系相關(guān)和高稀疏性分析工具:MiHC;

②MiHC是一種綜合數(shù)據(jù)驅(qū)動的檢測方法仆潮,考慮了微生物種系信息宏蛉、稀疏水平(極高稀疏水平下采用simes檢驗調(diào)節(jié));

③數(shù)據(jù)模擬分析表明在隨機種系相關(guān)和稀疏水平下MiHC比其它幾種工具功效要好性置;

④MiHC運用到四種真實數(shù)據(jù)中也證明其在未知種系相關(guān)和稀疏度下檢驗的結(jié)果更加穩(wěn)定拾并,MiHC也可運用于生存分析、中介分析等鹏浅;

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