今天一起了解下順式作用元件分布圖如何繪制仅淑！
上圖展示的是每個(gè)基因上游promoter區(qū)（基因位于負(fù)鏈則為下游哨免，長(zhǎng)度一般是起始密碼子前1500bp），順式作用元件種類及分布情況，具體某個(gè)數(shù)據(jù)時(shí)可以選擇自己感興趣的基因揩瞪、順式作用元件進(jìn)行展示。
今天給大家介紹一款非常簡(jiǎn)單實(shí)用的在線軟件GSDS：訪問(wèn)地址：http://gsds.cbi.pku.edu.cn便瑟；GSDS全拼是：Gene Structure Display Server?震捣，是一款很好用的基因結(jié)構(gòu)繪圖軟件，今天只給大家介紹下如何用GSDS進(jìn)行順式作用元件繪圖：
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備：
用GSDS繪制順式作用元件分布圖需提交2個(gè)數(shù)據(jù)酝锅，一是基因骨架信息诡必；二是順勢(shì)作用元件位置及名稱信息，兩文件格式是bed格式或者Excel表均可搔扁，如下圖：
1. 基因骨架信息BED文件：
如官方示例所示爸舒，提交的基因骨架信息BED文件由五列構(gòu)成，前四列是必填項(xiàng)稿蹲，第五列選填扭勉；第一列是基因ID，第二三列是提取的promoter區(qū)起止堿基苛聘，本示例數(shù)據(jù)取起始密碼子前1500bp序列進(jìn)行的順勢(shì)作用元件預(yù)測(cè)涂炎，所以表內(nèi)第二列寫(xiě)0忠聚，第三列寫(xiě)1500，第5列序列類型選擇CDS唱捣，本示例數(shù)據(jù)共選擇了72個(gè)感興趣基因進(jìn)行作圖两蟀，具體格式如下圖（部分展示）：
2.?順式作用元件位置及名稱信息BED文件：
順式作用元件位置及名稱信息文件格式如下：共4列組成，第一列是基因ID震缭，是對(duì)應(yīng)基因骨架BED文件中72個(gè)基因ID赂毯；第二、三列是每個(gè)順式作用元件起止位置拣宰，第四列是相應(yīng)順式作用元件名稱党涕，不感興趣的順式作用元件可在生成圖片后進(jìn)行選擇性展示：（部分展示）
3. 繪圖及美化
以上兩個(gè)數(shù)據(jù)準(zhǔn)備好后，即可上傳巡社，后點(diǎn)擊Submit開(kāi)始作圖膛堤，約1-2分鐘即可生成下圖：（部分展示）
不過(guò)，目前看來(lái)這個(gè)圖還是比較丑的重贺，不過(guò)沒(méi)關(guān)系骑祟，我們可以通過(guò)下方調(diào)整區(qū)控件進(jìn)行圖片美化：
最終在小編小編的努力下圖片稍微漂亮點(diǎn)：
好了，順式作用元件分布圖初步完成了气笙，后期所做的調(diào)整修改這里就不過(guò)多介紹了次企，大家自行參悟吧！生成圖片后GSDS網(wǎng)站提供SVG潜圃、PNG缸棵、PDF格式保存，同時(shí)網(wǎng)站還提供在線的片煸編輯工具谭期，不過(guò)試了下不是太好用堵第，(可能是小編電腦或網(wǎng)速問(wèn)題)，小編還是喜歡用AI軟件編輯像PDF等圖片隧出，AI軟件你知道是什么嗎踏志？用過(guò)嗎？下一期胀瞪，小編帶您一起AI編輯针余！
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