物種多樣性的指標(biāo)：
alpha diversity: 衡量一個集合體或一個環(huán)境中物種的多樣性阵翎。
beta diversity:衡量群落之間的差別，是生態(tài)系之間的種的多樣性。
gamma diversity: 一個環(huán)境中不同生態(tài)系的全部多樣性的度量。
UniFrac 距離是beta diversity 的群落比較方法，主要是基于系統(tǒng)發(fā)生樹比較咽块，利用不同樣品中OTU代表序列構(gòu)建進化樹，比較特定的進化譜系中是否有顯著的微生物群落差異虹蒋。對于系統(tǒng)發(fā)生樹所有枝糜芳，考查其指向的葉節(jié)點是否只存在于同一個群落，那些葉節(jié)點只存在于同一群落的枝的枝長和魄衅，占整個樹的枝長和的比例就是UniFrac距離峭竣。
UniFrac.png
weight UniFrac 不僅考慮生物群落的存在與否，還考慮其豐度晃虫。
參考文獻：
1皆撩、UniFrac: a new phylogenetic method for comparing microbial communites.
2、http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240101nlze.html
