使用Cox回歸分析進行生存數(shù)據(jù)分析

1夏漱、背景介紹

Cox回歸是一種用于生存分析的統(tǒng)計模型豪诲,最早由英國統(tǒng)計學家David Cox 命名,主要用于探究某些因素對于事件發(fā)生時間的影響程度挂绰。Cox模型是一種半?yún)?shù)模型屎篱,即只對協(xié)變量和風險函數(shù)(描述因子對生存時間的影響)作出了特定的分布假設(shè),而對基礎(chǔ)分布假設(shè)沒有作出限制葵蒂。

Cox回歸分析面對的問題是:“目標事件”(如死亡或疾病再發(fā)交播、復(fù)發(fā)等)在某些“危險因素”的影響下,何時發(fā)生践付。

在生存分析中秦士,探究“生存曲線”的斜率和它變化的原因是非常重要的,而Cox回歸提供了一種可靠的方法來揭示相關(guān)因素對于生存時間的影響永高。通常隧土,我們使用Cox回歸來比較在不同條件下(如藥物治療的應(yīng)用,疾病的嚴重程度等)的生存曲線命爬,以此來推斷不同因素對于生存時間的影響程度曹傀。

2、Cox 比例風險回歸模型

2.1 數(shù)據(jù)集

其中T代表min(T, C)饲宛,其中T為死亡時間皆愉,C為觀測截止時間。E代表是否觀察到“死亡”,1代表觀測到了幕庐,0代表未觀測到久锥,即生存分析中的“刪失”數(shù)據(jù),刪失數(shù)據(jù)共11個异剥。
var1,var2,var3代表了我們關(guān)系的變量奴拦,可以是是否為實驗組的虛擬變量,可以是一個用戶的渠道路徑届吁,也可以是用戶自身的屬性

2.2 比例風險Cox回歸

from lifelines.datasets import load_regression_dataset
from lifelines import CoxPHFitter

regression_dataset = load_regression_dataset()

print(regression_dataset.head())
print(regression_dataset['E'].value_counts())

cph = CoxPHFitter()
cph.fit(regression_dataset, 'T', event_col='E')
cph.print_summary()
cph.plot()

結(jié)果分析:從結(jié)果來看错妖,我們認為var1和var3在5%的顯著性水平下是顯著的。認為var1水平越高疚沐,用戶的風險函數(shù)值越大暂氯,即存活時間越短(cox回歸是對風險函數(shù)建模,這與死亡加速模型剛好相反亮蛔,死亡加速模型是對存活時間建模痴施,兩個模型的參數(shù)符號相反)。同理究流,var3水平越高辣吃,用戶的風險函數(shù)值越大。

這里還可以畫出每個參數(shù)的風險水平coef值:

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末芬探,一起剝皮案震驚了整個濱河市神得,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌偷仿,老刑警劉巖哩簿,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,126評論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異酝静,居然都是意外死亡节榜,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,254評論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進店門别智,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來宗苍,“玉大人,你說我怎么就攤上這事薄榛』淇撸” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 152,445評論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵蛇数,是天一觀的道長挪钓。 經(jīng)常有香客問我,道長耳舅,這世上最難降的妖魔是什么碌上? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 55,185評論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任倚评,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上馏予,老公的妹妹穿的比我還像新娘天梧。我一直安慰自己,他們只是感情好霞丧,可當我...
    茶點故事閱讀 64,178評論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開白布呢岗。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般蛹尝。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪后豫。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開封第一講書人閱讀 48,970評論 1 284
  • 那天突那,我揣著相機與錄音挫酿,去河邊找鬼。 笑死愕难,一個胖子當著我的面吹牛早龟,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播猫缭,決...
    沈念sama閱讀 38,276評論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼葱弟,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了猜丹?” 一聲冷哼從身側(cè)響起芝加,我...
    開封第一講書人閱讀 36,927評論 0 259
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎居触,沒想到半個月后妖混,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體老赤,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,400評論 1 300
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡轮洋,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 35,883評論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了抬旺。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片弊予。...
    茶點故事閱讀 37,997評論 1 333
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖开财,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出汉柒,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤责鳍,帶...
    沈念sama閱讀 33,646評論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布碾褂,位于F島的核電站,受9級特大地震影響历葛,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏正塌。R本人自食惡果不足惜嘀略,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 39,213評論 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望乓诽。 院中可真熱鬧帜羊,春花似錦、人聲如沸鸠天。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 30,204評論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽稠集。三九已至奶段,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間剥纷,已是汗流浹背忧饭。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 31,423評論 1 260
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留筷畦,地道東北人词裤。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 45,423評論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像鳖宾,于是被迫代替她去往敵國和親吼砂。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 42,722評論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容