概述
非編碼RNA额湘，根據(jù)其長度的不同可分為長鏈非編碼RNA和短鏈非編碼RNA营勤。轉錄本序列長度在200 bp 以上的非編碼RNA 通常被稱為長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）沟娱。
目前氛驮，lncRNA的發(fā)現(xiàn)主要是通過以下三種途徑：
- 傳統(tǒng)的遺傳學手段（如Xist、H19花沉、HOTAIR以及植物中的HID1等）柳爽；
- 芯片方法（如乳腺癌媳握、胰腺癌、肝癌等癌癥相關的lncRNA等）磷脯；
- 高通量RNA-seq方法鑒定(新的lncRNA等)蛾找。
分類
許多l(xiāng)ncRNA都具有保守的二級結構，剪切形式以及亞細胞定位赵誓，這種保守性和特異性表明它們是具有功能的打毛。但lncRNA的功能相對于microRNA和蛋白質的功能來說更加難以確定，因為目前并不能僅根據(jù)序列或者結構來推測它們的功能俩功。根據(jù)它們在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置幻枉， lncRNA可以分為五類：
（1）Antisense lncRNA (反義lncRNA) 與相反鏈上的轉錄產(chǎn)物部分或完全互補
（2）Enhancer lncRNA (增強子lncRNA) 由蛋白質編碼基因的增強子區(qū)域產(chǎn)生
（3）Large intergenic noncoding RNA (lincRNA) 由位于蛋白質編碼基因之間的序列獨立轉錄
（4）Bidirectional lncRNA (雙向lncRNA) 與蛋白質編碼基因共享相同的啟動子，但轉錄方向相反
（5）Intronic transcript lncRNA (內含子lncRNA) 由基因的內含子產(chǎn)生
另circRNA诡蜓，由轉錄產(chǎn)物剪接并形成共價閉合的環(huán)狀RNA熬甫。通常單獨做cirRNA鑒定分析，在此作為特殊的分類蔓罚。
功能
lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”椿肩，但近期研究表明，lncRNA參與了X染色體沉默豺谈、基因組印記以及染色質修飾郑象、轉錄激活、轉錄干擾茬末、核內運輸?shù)榷喾N重要的調控過程厂榛，這些調控作用也開始引起人們廣泛的關注。
根據(jù)其所處位置的不同丽惭，其發(fā)揮的作用也不相同击奶。核內lncRNA占lncRNA的大多數(shù)，通過招募染色質調節(jié)因子（chromatin modifiers）到DNA上來發(fā)揮調節(jié)作用吐根，或者作為一些核糖核蛋白的腳手架來發(fā)揮作用正歼。而胞漿中的lncRNA作用于基因的轉錄后水平的調節(jié)，如作為miRNA海綿（可以是環(huán)狀結構拷橘，也可以是線性結構）局义，抑制miRNA對mRNA的作用。同時lncRNA還可以影響到RNA的半衰期冗疮。
可總結如下：
- 作為RNA誘餌萄唇，結合轉錄因子，干擾其與基因promoter區(qū)域的結合术幔，從而調控轉錄另萤；
- 作為分子海綿，吸附miRNA，抑制其與mRNA的結合四敞，使得mRNA免于降解泛源；
- 作為蛋白互作的支架或橋梁，影響蛋白多聚物的形成忿危，調控蛋白活性达箍；招募染色質修飾因子，改變染色質的修飾水平铺厨，從而影響基因的轉錄和表達缎玫；
- 與mRNA配對結合，抑制翻譯解滓；
- 與mRNA配對結合赃磨，影響剪切；
- 與mRNA配對結合洼裤，影響mRNA的穩(wěn)定性邻辉。
lncRNA數(shù)據(jù)庫
常用lnc數(shù)據(jù)庫：NONCODE lncRNAdb LncRNome starBase lncRNASNP2 LncRNADisease
綜合型數(shù)據(jù)庫：RNAcentral
