華中農(nóng)業(yè)大學<br>園藝植物生物學教育部重點實驗室
IP屬地：陜西
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跟著BMC genomics學作圖：R語言ggplot2+ggtree進化樹拼接三角熱圖有讀者在公眾號留言問這個圖的實現(xiàn)辦法脆丁，今天的推文介紹一下這個圖的R語言實現(xiàn)代碼 這個圖示物種的進化樹，熱圖展示的是kaks的值 首先是進化樹的數(shù)據(jù) nwk格式的樹文件 還有一...
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收集一些生物信息學的分析流程的文章歼培。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題茸塞，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了躲庄。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的钾虐，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看噪窘。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節(jié)的比如熱圖效扫、曼哈頓圖的繪制等 ?? python倔监、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用菌仁，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法浩习，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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