生信分析流程 - 專題

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生信分析流程

收錄了194篇文章 · 2696人關(guān)注

超簡單python腳本實現(xiàn)Selenium+Xpath框架下批量自動通過文章名字識別文章類型并下載(還有不靠譜的機讀)
在這個不平凡的2020的最后幾天驾凶，林小姐的Group project分工分到了對155篇文章進行是否是RCT（Randomized Contro...

1.4 瓶瓶瓶平平 0 5
超詳細ggmaplot繪制差異基因火山圖
這次和大家分享下利用ggmaplot繪制差異基因篩選后的火山圖铛碑，用到的基因集是ggpubr里面自帶的數(shù)據(jù)集diff_express數(shù)據(jù)集可以看...

1.4 靈活胖子的進步之路 2 25

Bismark Bisulfite Mapper學習筆記（二）甲基化信息提取以及文件解讀
(IV)Bismark甲基化提取 Bismark附帶一個補充的bismark_methylation_extractor腳本马昨，它對Bismark...

1.1 生信start_site 1 25
Bismark Bisulfite Mapper學習筆記（一）數(shù)據(jù)預處理
官方手冊（2020 Sep更新）https://github.com/FelixKrueger/Bismark/tree/master/Docs...

1.8 生信start_site 2 30
shiny server The application failed to start.
#問題： #1. 檢查R包的安裝是否調(diào)用的所有R包都已安裝使用root安裝竞帽，在個人用戶下安裝是不行的。或鸿捧，下載到本地：注：檢查所有安裝的...

0.2 JeremyL 0 2
R Shiny App 布局：shinydashboard 設(shè)置背景
shinydashboard包提供了一組用于創(chuàng)建生成儀表板的HTML的函數(shù)抢呆。 #結(jié)構(gòu)概要 dashboardPage()函數(shù)包含三個組件: a ...

0.6 JeremyL 0 9
R shiny教程-2：布局用戶界面
Shiny 是RStudio公司開發(fā)的R包，利用Shiny 可以輕松構(gòu)建交互式Web應(yīng)用程序(App)笛谦。在前面一個 Shiny app的基本組...

0.1 JeremyL 3 3

R shiny教程-1：一個 Shiny app的基本組成部分
Shiny 是RStudio公司開發(fā)的R包抱虐，利用Shiny 可以輕松構(gòu)建交互式Web應(yīng)用程序(App)。 #安裝Shiny Shiny包中內(nèi)置了...

0.5 JeremyL 0 4
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個流程饥脑，并提供了基本的命令恳邀，用到的軟件包括BWA懦冰、samtools、gatk谣沸、Plink刷钢、Admixture...

6.9 追夢生信人 6 114
WGS分析筆記（7）—— 新的mapping工具
開始之前特別感謝從美國“人肉背回”這兩個軟件的小伙伴！@Olivia阿儀_鴉雀之前講過目前用的比較多的兩個二代測序基因組比對軟件乳附，bwa 和 ...

0.8 十三而舍 5 20