近期做hic掛載發(fā)現一個物種的染色體有問題,需要把對應兩條染色體的三代測序數據挑出,比對到兩條染色體上查看深度,以及挑出這部分序列重新拼接泛释,拿到...
近期在集群跑幾個污染分析的流程,從conda新裝了blast,之后報錯泻拦。 查詢可知,是因為blastn版本跟不上忽媒,但事實上我安裝了最新的blas...
1 安裝 參照“基因組結構預測|Braker3流程”這篇知乎文章https://zhuanlan.zhihu.com/p/659050212[h...
使用conda安裝HiTE 我本來打算安裝好之后使用conda-pack遷移到服務器使用争拐,運行之后發(fā)現有部分依賴并不能被conda-pack遷移...
本文從1 功能需求,2 硬件選擇,3 搭建過程 三個方面來闡述架曹。 1 功能需求 最近在進行植物基因組的組裝注釋和分析流程隘冲,需要一臺多線程的li...
使用conda安裝好EDTA環(huán)境 運行后發(fā)現LTR鑒定過程報錯 github搜索,發(fā)現問題與LTR_retriever有關绑雄,遂指定LTR_ret...
使用conda安裝了Repeatmodeler展辞,版本為Version 2.0.5。在基因組重復序列注釋過程中運行時間 過長万牺,而且最終產生的文件中...
conda配好環(huán)境之后罗珍,運行結果如下 經群友指點之后發(fā)現,在fastq文件夾中的hic測序文件格式脚粟,需要遵循_R1.fastq或者_R1.fas...
根據b站基因課視頻修改覆旱,按照輸入文件名輸出四個富集圖像。