第一步 數(shù)據(jù)獲取與前期準(zhǔn)備 從NCBI上下載GEO數(shù)據(jù)后解壓，在Rstudio中加載需要的package 第二步 讀取數(shù)據(jù)并進(jìn)行質(zhì)控 讀取數(shù)據(jù) 進(jìn)行質(zhì)控 過濾線粒體DNA含量...
IP屬地：四川
-
lesson1 單一樣本的scRNA測(cè)序pipeline
-
lesson2 多個(gè)樣本的scRNA測(cè)序整合分析pipeline
當(dāng)多個(gè)樣本一同進(jìn)行分析時(shí)，需要將多個(gè)樣本進(jìn)行整合，目的是讓不同樣本的細(xì)胞均勻地分布到各個(gè)cluster中。整合方法主要有錨點(diǎn)法和harmony法拷淘。 錨點(diǎn)法 錨點(diǎn)法整合速度很慢...