生物信息學菜鳥一只
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SPADES安裝和組裝 安裝 ./spades.py -h # 運行配置環(huán)境變量 測試一下:spades.py -h 組裝基因 注:這個過程有點長呀狼,建議在執(zhí)行之前使用scre...
1.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下: (1) 測序得到raw reads序列裂允。 (2) Reads質量評估。 (3) 原始reads質控哥艇。 (4) 選擇合適的參數(shù)...
SPAdes是一款十分常用的基因組組裝軟件貌踏,可以做RNA拼接十饥,質粒拼接,宏基因組拼接哩俭,新冠病毒拼接绷跑。適合細菌、真菌使用凡资,如果基因組大小超過100M砸捏,就要謹慎使用谬运。可二代數(shù)據(jù)拼...
作業(yè)記錄:用預編譯方式在自己的Ubuntu系統(tǒng)虛擬上機安裝生物信息軟件SPAdes 和大部分軟件安裝過程相同,SPAdes軟件的安裝過程也分為下載和解壓兩部分掂骏,并為軟件設置快...