SPADES安裝和組裝 安裝 ./spades.py -h # 運(yùn)行配置環(huán)境變量 測(cè)試一下：spades.py -h 組裝基因 注：這個(gè)過(guò)程有點(diǎn)長(zhǎng)躏啰，建議在執(zhí)行之前使用scre...
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基因組拼接與評(píng)估-SPADES安裝和組裝、Velvet安裝與運(yùn)行2022-10-04 -
基因組組裝----SOAPdenovo21.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下： (1) 測(cè)序得到raw reads序列。 (2) Reads質(zhì)量評(píng)估瓮具。 (3) 原始reads質(zhì)控。 (4) 選擇合適的參數(shù)...
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關(guān)于SPAdes的轉(zhuǎn)錄本拼接功能的詳細(xì)說(shuō)明
SPAdes是一款十分常用的基因組組裝軟件，可以做RNA拼接名党，質(zhì)粒拼接叹阔，宏基因組拼接，新冠病毒拼接传睹。適合細(xì)菌耳幢、真菌使用，如果基因組大小超過(guò)100M欧啤，就要謹(jǐn)慎使用睛藻。可二代數(shù)據(jù)拼...
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Ubuntu中序列拼接軟件SPAdes的安裝作業(yè)記錄：用預(yù)編譯方式在自己的Ubuntu系統(tǒng)虛擬上機(jī)安裝生物信息軟件SPAdes 和大部分軟件安裝過(guò)程相同邢隧，SPAdes軟件的安裝過(guò)程也分為下載和解壓兩部分店印，并為軟件設(shè)置快...
