一西傀、背景介紹 通常玷氏,BED文件的overlap/intersect的操作剧董,可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì):...
每次遇到BAM文件flag值都有一些困惑通砍,時(shí)間越久越迷惑深浮。在此秕硝,針對(duì)BAM文件中的flag信息進(jìn)行梳理和解釋: 記錄于BAM文件的第2列暴浦,以bw...
今天介紹和測(cè)試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件崇败,BETA(Binding and Expression Target Analy...
背景 目前许师,已經(jīng)衍生出多種用于檢測(cè)染色質(zhì)開(kāi)放性的試驗(yàn)方法。比如僚匆, DNase-seq, FAIRE-seq和ATAC-seq搭幻,其中ATACA-s...
一咧擂、背 景 PacBio最新三代測(cè)序儀Sequel II芯片實(shí)現(xiàn)了更高通路,同時(shí)已經(jīng)支持barcode測(cè)序檀蹋,這樣方便混合多個(gè)組織松申、處理、物種等...
發(fā)現(xiàn)一篇帖子很受用俯逾,轉(zhuǎn)載至此贸桶,別無(wú)它用,侵刪桌肴。 一皇筛、關(guān)于 Dockerfile 我們知道 Docker 鏡像的生成方式有兩種,一種是基于現(xiàn)有容器...
什么是GRO-seq坠七? 來(lái)自靈魂的拷問(wèn) GRO-seq(Global nuclear Run-On sequencing)是一種專門測(cè)量新生RN...
一水醋、過(guò)濾與質(zhì)控 測(cè)序獲得一對(duì)fastq文件,命名為treatment和control彪置,各含兩個(gè)生物學(xué)重復(fù)拄踪,即:treatment_1、treat...
以下羅列了ChIP-seq數(shù)據(jù)分析中的ENCODE標(biāo)準(zhǔn)拳魁,針對(duì)不同的免疫共沉淀類型有不同的標(biāo)準(zhǔn)惶桐,以下從組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子2個(gè)方向介紹: 一、組蛋白 ...