00 緣起 最新的R 3.5 版本特別難安裝骇吭,而且很多新的包只能在R3.5版本上工作查刻。之前用 make source 的方式總是出錯醋安,R3.5的更新依賴太多挠羔,需要安裝很多依賴...
![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/10-e691107df16746d4a9f3fe9496fd1848.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
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一、背景介紹 通常,BED文件的overlap/intersect的操作日戈,可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計:Bedtolols inter...
今天介紹和測試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件谱轨,BETA(Binding and Expression Target Analysis)戒幔。 該分析整合了ChI...
我們都知道ChIP-seq生物信息分析流程主要涉及:數(shù)據(jù)過濾、序列比對土童、檢峰诗茎、模體(motif)分析。其核心的問題是尋找可靠的motif,也即轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點結(jié)合的序列特征敢订。...
ATAC文庫構(gòu)建通常借助Illumina的Nextera?(Illumina)試劑盒昭齐,然而Nextera文庫涉及的序列不同于其他形式的文庫。 ATAC試驗的模式圖 Tn5切割...
文章目的 隨著單細胞的研究越來越火熱矾柜,利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)對單細胞進行聚類命名的需求也越來越高阱驾,基因在不同細胞中選擇性表達造成了細胞的多樣性,因此怪蔑,對細胞進行命名關(guān)鍵點在于分析這些選...
發(fā)現(xiàn)一篇帖子很受用里覆,轉(zhuǎn)載至此,別無它用缆瓣,侵刪喧枷。 一、關(guān)于 Dockerfile 我們知道 Docker 鏡像的生成方式有兩種弓坞,一種是基于現(xiàn)有容器進行 commit 生成一個鏡...