微生物研究新世代 -- 三代全長(zhǎng)16S (Full-length 16S) 時(shí)至今日囚巴,微生物群落研究已全面進(jìn)入測(cè)序分析階段,當(dāng)前研究主流處于二代擴(kuò)增子與三代擴(kuò)增子交接的時(shí)段势誊。...
Dada 2 流程 DADA2數(shù)據(jù)處理不以序列相似度聚類,只進(jìn)行去重(或相當(dāng)于以100%序列相似度聚類)眶根,生成的是以ASV為單元的表格蜀铲;Vsearch數(shù)據(jù)處理與Usearch...
@今天沒回家 老師渔呵,如果只用awk等基本命令將第九列符合要求的長(zhǎng)度信息過濾怒竿,即刪掉不需要的行,然后表頭不做處理扩氢,這樣新生成的sam文件可以用于后續(xù)分析嗎耕驰?不知道這個(gè)表頭和正文有沒有對(duì)應(yīng)關(guān)系,更改后面的內(nèi)容不改表頭可不可以
bam文件截取指定長(zhǎng)度的序列截取長(zhǎng)度在50-100的序列 截取長(zhǎng)度為50录豺,51的序列
前幾天學(xué)習(xí)了文獻(xiàn)CUT&Tag[http://www.reibang.com/p/335aec753039]示启,了解了原理以后,可以跟著官網(wǎng)來學(xué)習(xí)如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
文章會(huì)同步發(fā)表于本人 github 和 github homepage 目錄 宏基因組binning簡(jiǎn)介binning原理2.1. 可用于binning的特征2.2. 從哪些...
參考: 嘉因生物講座視頻:CUT&Tag 技術(shù)解析和應(yīng)用 ChIP-seq 需要的數(shù)據(jù)量很大:組蛋白:10M; TF: > 50 M 交聯(lián) : 可能改變抗原表位,影響抗體結(jié)合...
完整流程微驶、注意事項(xiàng)浪谴、統(tǒng)計(jì)原理:http://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1111379.html[http://blog.sciencene...