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比對(duì)軟件比如bowtie并不支持比對(duì)fasta格式的文件,所以需要把fasta轉(zhuǎn)為fastq格式皂冰,但是fasta和fastq相比缺少質(zhì)量值鹊奖,所以...
參考自 https://www.biostars.org/p/64346/[https://www.biostars.org/p/64346/]...
需要提前安裝GenomicFeatures 和 tximport
1苛聘、鏈特異性測(cè)序的目的現(xiàn)在二代測(cè)序主要有PE和SE兩種策略,PE主要用于RNA-seq忠聚,SE主要用于小RNA測(cè)序(短片段文庫(kù)測(cè)序)设哗。PE測(cè)序,我...
很多人會(huì)使用PGA進(jìn)行葉綠體基因組注釋?zhuān)荘GA產(chǎn)生的genbank文件不夠規(guī)范网梢,對(duì)其進(jìn)行以下修改,能解決很多問(wèn)題:
如果我想把列表當(dāng)作單獨(dú)的一個(gè)域進(jìn)行輸出赂毯,直接print是最簡(jiǎn)單的方法澎粟,但是,輸出時(shí)會(huì)有方括號(hào)[]欢瞪,用join()這個(gè)函數(shù)就可以刪除掉這個(gè)方括號(hào)了活烙。
截取長(zhǎng)度在50-100的序列 截取長(zhǎng)度為50,51的序列