轉(zhuǎn)錄組分析策略 轉(zhuǎn)錄組分析策略根據(jù)有無參考轉(zhuǎn)錄組可以分為兩類： 有參比對—定量—差異分析—功能富集分析等 無參組裝—定量—差異分析—功能富集分析等image 無參考轉(zhuǎn)錄組序列...
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無參轉(zhuǎn)錄組序列組裝 — Trinity -
零基礎(chǔ)教程 | 我有一堆基因，如何預測TF-Gene調(diào)控網(wǎng)絡(luò)蔼囊？寫在前面 早晨起來，想起來很久很久以前普监，有一個用戶提出的優(yōu)化想法俱饿，覺得確實也合理，就更新了一下沮脖。順便也把相關(guān)插件使用詳細捋捋金矛，方便大伙搞清楚這些插件都拿來干啥芯急。早前，順手寫了...
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被子植物系統(tǒng)發(fā)育位置 雜記
被子植物中饼酿，無油樟目（Amborellales）榕酒、睡蓮目（Nymphaeales）和木蘭藤目（Austrobaileyales）并稱基部被子植物類群，取首字母組合成了ANA ...
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被子植物系統(tǒng)發(fā)育位置 雜記被子植物中，無油樟目（Amborellales）药版、睡蓮目（Nymphaeales）和木蘭藤目（Austrobaileyales）并稱基部被子植物類群辑舷，取首字母組合成了ANA ...
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TBtools基因家族分析詳細教程（1）寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強大的TBtools工具，作者詳細講解了基因家族的分析過程和意義槽片，課程購買地址何缓，講的很棒，可以試聽还栓。 一共分為4個部分TBtools基因家族分...
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文獻閱讀-三個Myb類的轉(zhuǎn)錄因子參與花粉管接收的過程本次閱讀的文獻剩盒，13年發(fā)表在《current biology》上的《Three MYB Transcription Factors Control Pollen Tube...
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全基因組復制 WGD |（一）簡介
01 什么是全基因組復制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復谷婆，...
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采用生物信息學方法篩選和分析白癜風差異表達基因【2】
承接上一篇：采用生物信息學方法篩選和分析白癜風差異表達基因【1】 一、對象與方法 1．基因數(shù)據(jù)集分析： 從GEO數(shù)據(jù)庫（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov...
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群體遺傳分析—LD連鎖不平衡本文轉(zhuǎn)載于百邁克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群體遺傳學研究中辽聊，LD連鎖不平衡分析是最常見的分析內(nèi)容波材，也是關(guān)聯(lián)分析的...
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【群體遺傳】選擇信號分析-Fst、Pi1.選擇信號分析—Fst選擇信號分析 概念 Fst：群體間遺傳分化指數(shù)身隐，是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法廷区，分化指數(shù)越大，差異越大贾铝。適用于亞群體間多樣性的比較隙轻。 用于衡量種群...
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0基礎(chǔ)看懂轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果及后續(xù)數(shù)據(jù)應(yīng)用人非生而知之者，無論是生活中還是科研中都會遇到各種陌生事物和難題垢揩，比如這種： 或者是這樣的： 此時你的心情可能是這樣的： 做科研的時候碰到了這種難題玖绿，又沒有系統(tǒng)指導的話，很可...
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使用MEGA7利用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的簡單小例子~視頻版錄制了視頻介紹了使用MEGA7利用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的簡單小例子叁巨，歡迎大家留言討論斑匪，有幫助的話記得三連啊锋勺！這次一定 https://www.bilibili.com/vid...
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跟著Nature Genetics學數(shù)據(jù)分析~SNP數(shù)據(jù)計算距離矩陣然后構(gòu)建NJ樹最近在看論文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
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SNP/InDel變異注釋解釋
當SNP/InDel calling完后蚀瘸，會采用annovar狡蝶、SNPEFF、VEF等軟件進行基因位置贮勃、數(shù)據(jù)庫等的注釋贪惹。 一些關(guān)鍵的致病的注釋解釋：1.splicing ...
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基于的ssr 遺傳多樣性分析NOTE 基于種群聚類,特有等位基因 基本概念 1 多態(tài)性條帶 個人理解就是ssr引物1 在位點 擴增出的 a b 2個條帶（2倍體），ab長度可能相同也可能不相同寂嘉。如果a條...
