240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    R 語(yǔ)言 PCA畫(huà)圖

    畫(huà)PCA輸入矩陣,分組 可以多個(gè)分組

  • 關(guān)于 數(shù)據(jù)庫(kù) 的 “ID”

    常用數(shù)據(jù)庫(kù) ID 序號(hào)ID 示例ID 來(lái)源一GLA, GLB, UGT1A1HGNC Gene Symbol(基因的官方名稱)二ENSG0000...

  • 關(guān)于報(bào)錯(cuò)的“語(yǔ)言”

    當(dāng)時(shí)重新按照R 的時(shí)候不小心點(diǎn)了中文,報(bào)錯(cuò)的時(shí)候經(jīng)常顯示中文報(bào)錯(cuò)欧聘,但是很不利于我們?nèi)ス雀铏z索迅矛,這行代碼可以解決

  • 神包 tinyarray——TCGA“ID轉(zhuǎn)化”一步到位

    確實(shí)這個(gè)R包用法非常簡(jiǎn)單榜跌,大部分的都是卡在下載部分 直接代碼下載 Github下載zip后本地下載 下載后可以直接用了担敌,trans_exp一鍵轉(zhuǎn)換

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    R語(yǔ)言:讀取csv文件后檀何,數(shù)據(jù)變成了因子重虑?

    最近遇到了一個(gè)比較奇怪的文件讀取錯(cuò)誤践付,導(dǎo)致后面數(shù)據(jù)格式不對(duì),畫(huà)圖直接出錯(cuò)(////_////)缺厉, 有一個(gè)表格文件csv格式永高,讀取數(shù)據(jù)進(jìn)R后,數(shù)據(jù)...

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    基礎(chǔ)圖型(關(guān)于繪圖區(qū)域)

    關(guān)于繪圖區(qū)域 概念英文縮寫(xiě)函數(shù)釋義主繪圖main plot area類比畫(huà)布芽死,整塊畫(huà)布繪圖邊距marginsmar()畫(huà)布上想要畫(huà)的地方的邊距外...

  • ESTIMATE 算法 與 腫瘤純度

    介紹 惡性實(shí)體瘤組織不僅包括腫瘤細(xì)胞乏梁,還包括與腫瘤相關(guān)的正常上皮和間質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞和血管細(xì)胞关贵∮銎铮基質(zhì)細(xì)胞被認(rèn)為在腫瘤生長(zhǎng)、疾病進(jìn)展和耐藥性中起重...

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    GEO數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)總結(jié)(三)ID轉(zhuǎn)換

    通過(guò)前面的數(shù)據(jù)下載揖曾,我們一般都可以得到如下矩陣落萎,為了后續(xù)分析及文章需要亥啦,我們則需要吧探針名轉(zhuǎn)化為gene_symbol ID轉(zhuǎn)化主要分為二步 Ⅰ...

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    R語(yǔ)言批量去掉“雙引號(hào)”

    在GEO讀取矩陣文件,或者其他文件的時(shí)候常常會(huì)碰到下面這樣的情況 這樣對(duì)后面的ID轉(zhuǎn)化非常不方便练链,所以我們要去掉雙引號(hào)代碼如下 但是要注意的是翔脱,...

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