最近抽空整理了以前寫的函數(shù)厅须，規(guī)范tinyarray包，反復(fù)檢查和優(yōu)化抬旺，調(diào)整了好久暖庄，終于得到下面的check結(jié)果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈，沒有那么快)整理了...
IP屬地：新疆
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寶藏R包tinyarray：常用圖表一鍵收走 -
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#LncRNA從入門到精通#LncRNA從入門到精通[https://mp.weixin.qq.com/mp/appmsgalbum?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&action=get...
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好記性不如爛筆頭肩钠，溫故而知新。踏實(shí)一些暂殖，不要著急价匠，你想要的歲月都會(huì)給你！
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R語(yǔ)言|基于Cox模型pec包深度驗(yàn)證轉(zhuǎn)自個(gè)人微信公粽號(hào)【易學(xué)統(tǒng)計(jì)】的統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)筆記：R語(yǔ)言pec包深度驗(yàn)證Cox模型[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw...
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@小劉劉劉 可能是GSE的問題呛每，有些GSE是要去原始數(shù)據(jù)提取的
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)總結(jié)（一）數(shù)據(jù)下載
非常感謝jimmy大神與生信技能樹一直以來(lái)的無(wú)私分享踩窖，自己學(xué)習(xí)的同時(shí)也伴隨著記錄，如有錯(cuò)誤的晨横，歡迎大家指正~~~~ 1.數(shù)據(jù)下載 Ⅰ洋腮、R代碼直接下載數(shù)據(jù) 建議以Rdata形式...
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關(guān)于 數(shù)據(jù)庫(kù) 的 “ID”
常用數(shù)據(jù)庫(kù) ID 序號(hào)ID 示例ID 來(lái)源一GLA, GLB, UGT1A1HGNC Gene Symbol（基因的官方名稱）二ENSG00000116717Ensemble...
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關(guān)于報(bào)錯(cuò)的“語(yǔ)言”
當(dāng)時(shí)重新按照R 的時(shí)候不小心點(diǎn)了中文，報(bào)錯(cuò)的時(shí)候經(jīng)常顯示中文報(bào)錯(cuò)啥供，但是很不利于我們?nèi)ス雀铏z索悯恍，這行代碼可以解決
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簡(jiǎn)書不再更新贷屎，個(gè)人主頁(yè) <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fkaopubear.top" target="_blank">https://kaopubear.top</a> 郵箱聯(lián)系 hi@kaopubear.top
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生信技能樹豫尽，生信菜鳥團(tuán)篙梢，jimmy
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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打擾您一下渤滞，代碼里面相關(guān)性和P值是cor.test（），請(qǐng)問這和皮爾森相關(guān)系數(shù)計(jì)算區(qū)別大嗎榴嗅？
R計(jì)算mRNA和lncRNA之間的相關(guān)性+散點(diǎn)圖
我們?cè)谧霰磉_(dá)譜數(shù)據(jù)分析的時(shí)候妄呕，經(jīng)常需要檢測(cè)基因兩兩之間表達(dá)的相關(guān)性。特別是在構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)的時(shí)候嗽测，我們需要去檢查構(gòu)成一對(duì)ceRNA的mRNA和lncRNA之間的表達(dá)是否呈...
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這個(gè)算法的網(wǎng)站有一句話“Plot displaying the ESTIMATE score for each sample under Affymetrix platform against background ESTIMATE scores for all the samples defined under Affymetrix platform.”绪励，我個(gè)人的理解是，平臺(tái)之間對(duì)于樣本背景有著不同的定義唠粥，可能有時(shí)候數(shù)據(jù)總體上差別不會(huì)很大疏魏，但是還是有存在影響個(gè)性的因素
ESTIMATE 算法 與 腫瘤純度
介紹 惡性實(shí)體瘤組織不僅包括腫瘤細(xì)胞，還包括與腫瘤相關(guān)的正常上皮和間質(zhì)細(xì)胞晤愧、免疫細(xì)胞和血管細(xì)胞大莫。基質(zhì)細(xì)胞被認(rèn)為在腫瘤生長(zhǎng)官份、疾病進(jìn)展和耐藥性中起重要作用; 浸潤(rùn)性免疫細(xì)胞的作用...
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plotly for R簡(jiǎn)介 交互式繪圖工具, 提供python, R, js接口, 以R接口為例 api類似, 需要注意在參數(shù)中涉及子項(xiàng)的在R中使用列表, 在python中使用字典 支持管道符操作...
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選只厘，多因素cox建模，時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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神包 tinyarray——TCGA“ID轉(zhuǎn)化”一步到位
確實(shí)這個(gè)R包用法非常簡(jiǎn)單舅巷，大部分的都是卡在下載部分 直接代碼下載 Github下載zip后本地下載 下載后可以直接用了羔味，trans_exp一鍵轉(zhuǎn)換
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