發(fā)簡信
IP屬地：福建
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利用QTL-seq軟件進(jìn)行BSA定位分析最近逛Github，發(fā)現(xiàn)一個(gè)新出的BSA自動(dòng)化流程，就叫QTL-seq[https://github.com/YuSugihara/QTL...
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一套比較簡便的基因組組裝流程V2.0
之前寫過 一套比較簡便的基因組組裝流程[http://www.reibang.com/p/a736b1b4b188]沈堡，時(shí)間快2年了，現(xiàn)在新技術(shù)...
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利用quickmerge對(duì)基因組組裝的contig去重
quickmerge是一個(gè)用來去除基因組組裝中的重復(fù)的軟件燕雁。 該軟件沒有單獨(dú)的文章诞丽，是作為某個(gè)基因組組裝中的衍生腳本鲸拥。該基因組文章是 Impro...
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利用Juicer v2.0掛載染色體
最近在搞基因組，前面contig的組裝難度不大僧免，用wtdbg2刑赶、raven、mecat2懂衩、flye等組裝就可以了撞叨。 組裝完畢后，contig掛載...
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利用masurca進(jìn)行混合二勃痴、三代測序數(shù)據(jù)基因組組裝
現(xiàn)在組裝新基因組谒所，一般用pacbio的hifi測序模式進(jìn)行olc組裝+Hi-c輔助組裝染色體就行了，但是我們實(shí)驗(yàn)室以前測了一些基因組是低覆蓋度的...
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一套比較簡便的基因組組裝流程
這套流程主要特點(diǎn)是消耗資源比較少沛申，1G以內(nèi)的基因組劣领，內(nèi)存不要低于128G，最好能搞到256G铁材，但是再多對(duì)這套流程用不上尖淘，更大的基因組沒有測試過。...
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rnaflow 一個(gè)新的全自動(dòng)RNA_Seq數(shù)據(jù)分析流程最近接了個(gè)幫學(xué)院其他老師分析水稻轉(zhuǎn)錄組的活著觉，但是媳婦趕著畢業(yè)村生，要幫她搞文章和數(shù)據(jù)，沒空干這個(gè)饼丘，自己雖然會(huì)分析轉(zhuǎn)錄組趁桃，但是一直沒有實(shí)現(xiàn)自動(dòng)...
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多線程將SRA文件轉(zhuǎn)化為fastq.gz文件
利用NCBI數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的時(shí)候，遇到的第二個(gè)問題就是如何將SRA文件轉(zhuǎn)化為常用的fastq文件肄鸽。 NCBI官方提供的SRAtoo...
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利用aria2快速下載SRA數(shù)據(jù)SRA數(shù)據(jù)就不多說了卫病，目前我遇到的問題是，學(xué)校網(wǎng)絡(luò)不太行典徘，怎么批量快速的下載蟀苛？ 時(shí)代久遠(yuǎn)，原來我是怎么獲得大量的SRA下載地址已...