1 vConTACT2的安裝 根據(jù)官網(wǎng)[https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact2/src/master/]的安裝說(shuō)明喘批，采用推薦的C...
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GTDB基因組分類數(shù)據(jù)庫(kù)及GTDB-Tk工具Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一個(gè)專注于基因組分類學(xué)的數(shù)據(jù)庫(kù)迁霎，旨在提供高質(zhì)量的細(xì)菌渊胸、古細(xì)菌、葉綠體和線粒體的分類信息...
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@小周的萬(wàn)用膠囊 好的数苫，謝謝
生信log6細(xì)菌全基因組建樹(shù)|基于GTDB-KT抽單拷貝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建樹(shù)
前言 最近在跑一個(gè)很大的數(shù)據(jù)集他托，大概有3500條以上的基因序列礼仗，因?yàn)閿?shù)量太大祸憋，跑樹(shù)有點(diǎn)搞不定会宪，特此來(lái)記錄一下這個(gè)過(guò)程 超過(guò)3000個(gè)基因組iqtree直接跑斷直接跑了iqtr...
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R繪制優(yōu)美的進(jìn)化樹(shù)（進(jìn)階）上次已經(jīng)介紹過(guò)了使用R繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的基本用法[http://www.reibang.com/p/b6c4d3376bc9]，也埋下一個(gè)小坑：復(fù)現(xiàn)文章里好看的樹(shù)蚯窥，現(xiàn)在過(guò)來(lái)填...
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生信博士生一枚沟沙，分享科研代碼河劝，經(jīng)驗(yàn)。推文一般很長(zhǎng)矛紫，努力將一個(gè)問(wèn)題講全面赎瞎，感謝你的耐心閱讀。
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生信log6細(xì)菌全基因組建樹(shù)|基于GTDB-KT抽單拷貝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建樹(shù)
前言 最近在跑一個(gè)很大的數(shù)據(jù)集颊咬，大概有3500條以上的基因序列务甥，因?yàn)閿?shù)量太大，跑樹(shù)有點(diǎn)搞不定喳篇，特此來(lái)記錄一下這個(gè)過(guò)程 超過(guò)3000個(gè)基因組iqtree直接跑斷直接跑了iqtr...
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你好敞临，我想問(wèn)下，一步法和分步法抽出來(lái)的marker gene是一樣的嗎麸澜？應(yīng)該都可以用與建樹(shù)吧
生信log6細(xì)菌全基因組建樹(shù)|基于GTDB-KT抽單拷貝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建樹(shù)
前言 最近在跑一個(gè)很大的數(shù)據(jù)集挺尿，大概有3500條以上的基因序列，因?yàn)閿?shù)量太大炊邦，跑樹(shù)有點(diǎn)搞不定编矾，特此來(lái)記錄一下這個(gè)過(guò)程 超過(guò)3000個(gè)基因組iqtree直接跑斷直接跑了iqtr...
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全網(wǎng)同名
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不做無(wú)條件咨詢碘菜，見(jiàn)諒
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低級(jí)生物信息工程師忍啸。<br>僅限于學(xué)習(xí)交流用途仰坦，請(qǐng)勿打賞！<br>
