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  • 您好岂傲,請(qǐng)教一下地梨,公司技術(shù)告訴我,他們處理全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)偷遗,只是將完全一致的序列去掉了,相同的但是長(zhǎng)短不一的序列會(huì)被留下兰吟。那我應(yīng)該怎么處理數(shù)據(jù)觅廓,能去掉這些重復(fù)的序列呢

    iso-seq全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本

    這個(gè)是我在聽報(bào)告時(shí)聽到的,對(duì)這個(gè)比較感興趣站蝠,這里作為學(xué)習(xí)筆記 關(guān)于iso-seq 首先介紹下iso-seq汰具,這是基于PacBio的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序,隸屬于三代測(cè)序菱魔,其特點(diǎn)是超長(zhǎng)...

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    全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的鑒定

    作者:Arno審稿:童蒙編輯:angelica 全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Isoform-sequencing藻治,Iso-seq)基于PacBio單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)(SMRT cell)...

  • 我也是一樣的問題碘勉,請(qǐng)問您解決了嗎

    基因家族專題(3):基因家族成員的鑒定

    Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容,下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了桩卵。首先回顧一下验靡,下載好的數(shù)據(jù)。 基因組序列信息雏节,存儲(chǔ)基因組序列信息的.fasta文件胜嗓。還有其...

  • 多序列比對(duì)

    最經(jīng)典和廣為熟知的多序列比對(duì)軟件是 clustalw 。 但是現(xiàn)有的多序列比對(duì)軟件較多钩乍,有文獻(xiàn)報(bào)道:比對(duì)速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee)辞州,...

  • 您好最后一步需要根據(jù)identity大于百分之多少進(jìn)行進(jìn)一步篩選嗎

    生信小白必備工具:BLAST

    這期開始將會(huì)系統(tǒng)的介紹一些生信初學(xué)者經(jīng)常使用的工具变过,流程,敬請(qǐng)大家關(guān)注涝涤。首先今天和大家講講本地版的BLAST媚狰,一款作為生信工作者的你,這個(gè)是你每天都會(huì)用到的工具阔拳。這個(gè)網(wǎng)頁(yè)版的...

  • 你好,我想問下沒有參考基因組彭羹,測(cè)了二代和三代數(shù)據(jù)黄伊,分析流程是否與基因組的不一樣呢,那么應(yīng)該如何分析呢

    轉(zhuǎn)錄組分析入門 2 —— 基本流程

    ?? 注:此文基本全部按照 簡(jiǎn)書 劉小澤:轉(zhuǎn)錄組那些事兒 Part II 進(jìn)行派殷,感謝??还最,以下代碼親測(cè)有效,如有問題歡迎隨時(shí)與我溝通毡惜。 準(zhǔn)備工作?? 1. 登錄服務(wù)器(本小白...

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