很久不見市怎。錯(cuò)過(guò)了很多的詢問(wèn)和回復(fù)媳友,很抱歉。這段時(shí)間在整理我的第一篇paper蚜退,大部分涉及的東西不太具有可分享性(其實(shí)也是應(yīng)該記錄的)——————...
最近在學(xué)習(xí)當(dāng)下很火的環(huán)狀DNA(eccDNA)的建庫(kù)技術(shù)以及生信分析,特此記錄探膊。 No.1 去低質(zhì)量&去接頭 這一步需要注意的是低質(zhì)量堿基的qu...
記錄今天學(xué)會(huì)的一個(gè)小知識(shí):統(tǒng)計(jì)測(cè)序文件的reads長(zhǎng)度分布 由于某些原因赋秀,需要統(tǒng)計(jì)reads長(zhǎng)度分布對(duì)建庫(kù)方法進(jìn)行質(zhì)控利朵,對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行可用與否的...
這一筆記的主要目的是記錄學(xué)習(xí)和實(shí)踐過(guò)程,所寫皆嘗試過(guò)為可用操作猎莲,看到的各位小伙伴有更好的操作歡迎隨時(shí)交流~ 1. 創(chuàng)建 R 4.0以上的con...
發(fā)現(xiàn)年紀(jì)越大越容易不記得事情绍弟,以前記在本子上,收藏夾里的回憶都因?yàn)檎也坏奖咀又荨Q了電腦而丟失樟遣,再想回去看看時(shí),幾番尋找都再得不到身笤。凡此過(guò)往豹悬,皆為...
今天要記錄一個(gè)很實(shí)用的實(shí)驗(yàn)技巧:如題液荸,怎么利用低濃度的質(zhì)粒包好慢病毒嗎瞻佛? 慢病毒已經(jīng)成為目前生命科學(xué)領(lǐng)域一個(gè)很常用的進(jìn)行基因表達(dá)調(diào)控的實(shí)驗(yàn)方法了...
課題需要某一篇已發(fā)表文章的基于10x Genomics平臺(tái)的scATAC-seq數(shù)據(jù),于是乎娇钱,開始了踩坑指南伤柄。 No.1 數(shù)據(jù)下載 眾所周知,公...
今天這篇筆記主要是記錄一些查找的腦細(xì)胞系相關(guān)的資料忍弛。 接下來(lái)需要進(jìn)行一些細(xì)胞系的實(shí)驗(yàn)响迂,因此在查找合適的已經(jīng)建好的能夠在體外培養(yǎng)的human br...
最近在做一批樣本细疚,是基于大規(guī)恼嵬基因組測(cè)序?qū)ふ倚碌募膊∠嚓P(guān)突變位點(diǎn)(snv)和indel等的。 軟件給出的結(jié)果一般都是以下形式疯兼,給出的只有突變所在...