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R語言 -- quantile 函數(shù)計(jì)算內(nèi)距IQR
1 四分位數(shù) 四分位數(shù)百度(Quartile)是一種統(tǒng)計(jì)描述分析方法署惯，用于描述任何類型的數(shù)據(jù)咱旱，尤其是偏態(tài)數(shù)據(jù)的離散程度,即將全部數(shù)據(jù)從小到大排列更鲁，正好排列在下?1/4?位置上...
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TCGA數(shù)據(jù)庫MAF文件的分析以及可視化（maftools包的使用）這兩天“王院長(zhǎng)”幫別人分析snv數(shù)據(jù)搬素，順便給我推薦了一個(gè)R包：maftools呵晨。我看了一下官網(wǎng)，感覺是個(gè)非常強(qiáng)大的R包熬尺。那必須要學(xué)習(xí)起來~實(shí)際上網(wǎng)上已經(jīng)有很多教程了摸屠，但都是用...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心季二，又辜負(fù)了努力
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maftools畫棒棒糖圖 （Lollipop chart）-基因突變可視化maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語言可視化包，上篇“maftools畫瀑布圖（oncoplot）”(http://www.reibang.com/p/6cccf7c4bb0...
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生信技能樹，生信菜鳥團(tuán)绊含，jimmy
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【原創(chuàng)干貨】一文搞清楚病例對(duì)照研究和隊(duì)列研究躬充！如果你是初到臨床逃顶，首先接觸到的可能不是脫離本科藍(lán)色生死戀的快感讨便，而是無限循環(huán)每天早上的查房交班，開藥口蝠，治療等等器钟。 除此之外，你的老板還可能某天說：“誒妙蔗，小王傲霸，來臨床這么久了，...
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今天師兄教你一個(gè)SCI常用的箱圖繪制，包你學(xué)會(huì)
作者：本文作者Trigo Hoang寸五，作者目前在香港攻讀博士學(xué)位博士梳凛，碩士期間發(fā)表了多篇生信相關(guān)的SCI，公眾號(hào)簡(jiǎn)書會(huì)記錄作者學(xué)習(xí)生信期間的一些小筆記梳杏，希望能跟正在學(xué)習(xí)生信的...
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TCGA+biomarker——C-index
通常情況下韧拒，通過以下幾種指標(biāo)來對(duì)模型進(jìn)行評(píng)價(jià)。1）區(qū)分度：采用指標(biāo)C-index和ROC曲線來評(píng)價(jià)區(qū)分度十性，一般文章都是二選一叛溢。 C-index即一致性指數(shù)（index of ...
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Nomogram(諾莫圖/列線圖)在R中的實(shí)現(xiàn)本筆記來源于CSDN論壇樓主 anshiquanshu[https://blog.csdn.net/anshiquanshu] 的帖子：R繪制Nomogram圖的學(xué)習(xí)筆記[h...
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R語言繪制生存曲線95%區(qū)間1. 安裝和加載包 繪制Kaplan-Meier生存曲線需要用到的R包：survminer和survival。 library(survminer) # 加載包 librar...
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R|生存分析 - KM曲線 劲适，值得擁有姓名和顏值
生存分析作為分析疾病/癌癥預(yù)后的出鏡頻率超高的分析手段楷掉，而其結(jié)果展示的KM曲線也必須擁有姓名和顏值！ 生存分析相關(guān)推文： 生存分析和KM曲線：R|生存分析（1） 分析結(jié)果一鍵...
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Nomogram繪制-基于R語言rms包的經(jīng)典方法
作者：白介素2 文章內(nèi)容簡(jiǎn)介：應(yīng)用R語言中的rms包繪制經(jīng)典列線圖霞势，構(gòu)建基于logistic模型烹植，及cox風(fēng)險(xiǎn)比例模型，計(jì)算C-index的多種方法演示愕贡。 Calibrati...
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SEER數(shù)據(jù)庫 常用發(fā)文方法：Nomogram草雕，給你的文章增加“亮點(diǎn)”
一篇論文需要有自己的亮點(diǎn)」桃裕《拉丁美洲研究》編輯委員Fiona Macaulay曾經(jīng)說過：“不要把你的亮點(diǎn)藏得像大海撈針一樣”促绵。 Nomogram就是這樣一種可以清晰簡(jiǎn)潔地展示...
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R語言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷作者：白介素2 相關(guān)閱讀：R語言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語言生存分析-02-ggforestR語言生存分析-01ggpub...
