安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh双戳。需要輸入yes然后等...
這是最近趕的一個 deadline 作品川陆,之前答應了 rOpenSci 投一個 technote 小博文剂习。因為不能重復包 Vignette 的內(nèi)容,所以本文我使用了生存分析這...
@周運來就是我 嗯,我再看看
scRNA-seq數(shù)據(jù)分析 || Monocle3同系列文章: sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.reibang.com/p...
是導入已經(jīng)標準化并降維的seurat對象還是直接導入cellranger的output文件到monocle购对,然后再進行標準化降維處理好呢猾昆,這兩個包我已經(jīng)分不清該用哪個做質控,降維骡苞,可視化了垂蜗,monocle就多了擬時序分析吧
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為什么要做單細胞? 可以得到單個細胞的表達譜 可以發(fā)現(xiàn)新的細胞類型或者細胞狀態(tài)(這里面往往蘊含著未知的生物學狀態(tài)或者過程) 識別細胞發(fā)育軌跡或者病變細胞發(fā)生發(fā)展進程霜定。 數(shù)據(jù)分...
數(shù)據(jù)轉換 data transfer,是將數(shù)據(jù)從一種表示形式變?yōu)榱硪环N表現(xiàn)形式的過程档悠。我們喂給程序的數(shù)據(jù)在任何一個階段都要符合這個程序的數(shù)據(jù)要求廊鸥,可視化也好,聚類也好辖所,每一種...