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放一張效果圖,這些,三四年前的東西,我其實(shí)一直懶得說(shuō)。 寫(xiě)在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說(shuō)屯曹,也是一時(shí)興起寫(xiě)出來(lái)的。開(kāi)發(fā)的...
進(jìn)化樹(shù)或者系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)在微生物及群體結(jié)構(gòu)分析中是很常見(jiàn)的分析條目惊畏。進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建有很多方法恶耽,結(jié)果也大體相似,但是最終呈現(xiàn)的形式確是多種多樣的颜启,今天給大家介紹使用itol進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)的...
安裝時(shí)間:2021.2.4 1. 簡(jiǎn)介 多序列比對(duì)在生物信息分析中是常用到的操作,目前多序列比對(duì)的軟件較多缰盏,沒(méi)有一款十分完美的多序列比對(duì)工具涌萤。有文獻(xiàn)報(bào)道: 在比對(duì)速度上(Mu...
mafft可以用來(lái)進(jìn)行快速的序列比對(duì),因?yàn)槠淇梢栽O(shè)置多線程口猜。具體的命令行如下: 接下來(lái)等著運(yùn)算完就可以使用iqtree來(lái)建樹(shù)了负溪,具體命令行如下: -b指代的是bootstra...
前面推文所提基本性質(zhì)的分析(理化性質(zhì),基因染色體分布须尚,基因結(jié)構(gòu)崖堤、基序和保守結(jié)構(gòu)域)已完成侍咱,進(jìn)一步基因家族成員的進(jìn)化分析可以推測(cè)未知基因的功能,也會(huì)讓文章更為完整密幔。進(jìn)化分析包括...
Mapchart不僅能繪制高密度連鎖群放坏,還能標(biāo)注QTL、繪制LOD變化曲線老玛、不同圖譜共線性比較等 功能齊全,使用簡(jiǎn)單钧敞。這次我主要學(xué)習(xí)的是用Mapchart在染色體上標(biāo)記出多個(gè)...
前面推文已經(jīng)把家族基因的成員確定了镜廉,現(xiàn)在對(duì)這些成員做一些基本的分析,包括1.理化性質(zhì)分析愚战、親/疏水性娇唯,有無(wú)信號(hào)肽/跨膜結(jié)構(gòu)域和亞細(xì)胞定位。做成表格寂玲,其他分析大都圖片形式)2....
@Charon_7db5 哦哦是校友哦塔插,我大二也在做這個(gè),老師還給我推薦了你的文章??
“復(fù)盤(pán)”:農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)型碩士的2.5年拓哟。2019年6月本科畢業(yè)想许,從園林調(diào)劑到了農(nóng)藝與種業(yè),2019年7月正式進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室開(kāi)始學(xué)習(xí)培訓(xùn)断序,2022年1月順利畢業(yè)流纹。讀研期間,課題是國(guó)家自然科學(xué)基因項(xiàng)目的一部分违诗,但是大部分內(nèi)...
@Charon_7db5 是zafu嘛??
“復(fù)盤(pán)”:農(nóng)學(xué)專(zhuān)業(yè)型碩士的2.5年漱凝。2019年6月本科畢業(yè),從園林調(diào)劑到了農(nóng)藝與種業(yè)诸迟,2019年7月正式進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室開(kāi)始學(xué)習(xí)培訓(xùn)茸炒,2022年1月順利畢業(yè)。讀研期間亮蒋,課題是國(guó)家自然科學(xué)基因項(xiàng)目的一部分扣典,但是大部分內(nèi)...
持續(xù)更新ing.....最后更新時(shí)間:2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限: eg: 7=4+2+1 #代表w+r+x權(quán)限...
一篇生信家族的文章比較重要的一步是家族成員的確定湿硝,所有基本分析和進(jìn)化分析都是基于此薪前。 前面推文提到本人的參考物種是模式植物擬南芥,因此我首先下載了很多關(guān)于擬南芥的綜述類(lèi)和研究...