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    ATAC-seq分析

    ATAC-seq分析 所用到的軟件和ChIP-seq一樣搅裙,所以直接在ChIP環(huán)境下進(jìn)行即可 MD5值校驗(yàn) 用trim-galore軟件質(zhì)控過濾扰魂,...

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    2022-08-01

    ChIP-seq分析 創(chuàng)建小環(huán)境 安裝軟件 數(shù)據(jù)下載 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換没佑,sra格式轉(zhuǎn)換為fastq格式 |單個(gè)命令如下 過濾冯乘,用trim-galore軟...

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    轉(zhuǎn)錄組上游流程

    一.安裝miniconda/annaconda 1.下載 2.安裝 3.確認(rèn)安裝成功 調(diào)出幫助文檔 4.配置鏡像(安裝一次配置一次即可) 二目代、創(chuàng)...

  • linux基礎(chǔ)(2)

    環(huán)境變量 在某一環(huán)境的變量靴迫,比如登錄時(shí)的當(dāng)前環(huán)境濒蒋。投遞任務(wù)時(shí)的環(huán)境變量以及賦值的變量等盐碱。能在環(huán)境中取到的變量內(nèi)容!可以清空、賦值變量避免賦值PA...

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    2019-07-23(Linux基礎(chǔ))

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    2019-07-21日學(xué)習(xí)總結(jié)

    array與循環(huán) array 數(shù)組是矩陣的集合?array(data = NA, dim = length(data), dimnames = ...

  • 2019-07-20學(xué)習(xí)總結(jié)

    step_1 創(chuàng)建向量 函數(shù)c() 瓮顽、 sep() 县好、 rep() 、 paste() 趣倾、 paste0() step_2 索引 可以用位置聘惦、名...

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    2019-07-18聽課總結(jié)

    內(nèi)容 ? 循環(huán)-數(shù)組|數(shù)據(jù)框? 循環(huán)-因子? 循環(huán)-while| if else? 數(shù)據(jù)處理-排序|集合|長寬? 字符操作及其他 心得: 聽曉娟...

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    表達(dá)矩陣log后進(jìn)行差異分析

    關(guān)于limma包差異分析結(jié)果的logFC解釋 http://www.bio-info-trainee.com/1209.html 首先,我們要明...

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