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  • IQ-tree2構建系統發(fā)育樹使用小結

    IQ-TREE是一款用于系統發(fā)育推斷的高效軟件(Efficient software for phylogenomic inference)钓简,其主要具有以下特點:1.高效的樹...

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    SPAdes安裝及運行

    SPAdes的安裝: 源代碼安裝: 將文件夾解壓縮到指定位置 進入文件所在目錄查看安裝情況 定義環(huán)境變量 在根目錄下查看安裝是否成功 SPAdes組裝短序列基因組

  • 基因組組裝----SPAdes(一)

    關于基因組組裝的流程可以參考我的簡書:http://www.reibang.com/p/e02ecd537c83 前面介紹了SOAPdenovo2的使用胞四,但是由于結果整體不...

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    基因組組裝----SOAPdenovo2

    1.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下: (1) 測序得到raw reads序列辜御。 (2) Reads質量評估撬陵。 (3) 原始reads質控枣氧。 (4) 選擇合適的參數...

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    Beast系統發(fā)育關系和分化時間的估算(上)

    以下內容參考了同研究組師弟整理的筆記拦宣、和網絡資源:Beast v1.8簡易手冊-修訂版 · 語雀 (yuque.com)[https://www.yuque.com/wush...

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    IQ-TREE最大似然法構建系統發(fā)育樹的神器

    IQ-TREE:最大似然法構建精確鸵隧、快速绸罗、靈活、廣泛的系統發(fā)育樹 IQ-TREE自2011年就已經開發(fā)并開源豆瘫,至今都有專業(yè)團隊維護珊蟀,其名字來源于IQPNNI和TREE-PUZ...

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