現(xiàn)在都是流行追熱點，例如m6A這個研究熱點，很多人利用它發(fā)了n篇純生信數(shù)據(jù)挖掘的文章；再比如鐵死亡這個研究熱點魏身，有一大堆純數(shù)據(jù)挖掘的文章正在投稿中；現(xiàn)在我們看看這個已經(jīng)發(fā)了無...
發(fā)簡信
IP屬地：河北
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抓住一個熱點，可以發(fā)無數(shù)篇純生信SCI
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學習筆記——投資就是時間上的平衡消費
今天講經(jīng)濟學怎么看待投資和消費之間的關系。 你覺得投資和消費兩者之間烤宙，投資就是投資，消費就是消費俭嘁，這不是很清楚么躺枕？我問你，今天中午吃盒飯供填，這是投資還是消費拐云？吃飯當然是消費，但...
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GSEA富集分子下游通路 一
GSEA下載 進入下載頁面近她，首先需要注冊郵箱叉瘩，然后按照電腦系統(tǒng)要求點擊下載就Ok了。鏈接如下： https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downlo...
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推薦這本新辦的雜志起點8分粘捎，預計2020年發(fā)文量過千薇缅，影響因子繼續(xù)8分！雜志概要 今天要介紹的期刊是cancer immunology research晌端，創(chuàng)刊于2013年捅暴，同Clinical Cancer Research、Cancer Rese...
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單細胞問題匯總入門必讀：http://www.reibang.com/p/85e2e38df673 Q1:有的群2個或者3個不同細胞類型marker高表達咧纠，這時候如何給群定義具體哪種細胞...
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拿到基因表達矩陣之后的那點事(一)做轉(zhuǎn)錄組一般拿到基因表達矩陣之后工作即可開始做差異分析蓬痒，在此之前還有一步就是對矩陣做標準化，常見的幾種RPKM漆羔、FPKM梧奢、TMM等狱掂，雖然RPKM、FPKM方法被吐槽的尤為厲害...
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TCGA+biomarker——Nomogram列線圖
列線圖簡介 列線圖（Alignment Diagram）亲轨，又稱諾莫圖（Nomogram圖）趋惨，它是建立在多因素回歸分析的基礎上，將多個預測指標進行整合惦蚊，然后采用帶有刻度的線段器虾，...
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count normalization的代碼
在前面的count normalization的方法部分，我初步介紹了一些常見的count normalization的方法蹦锋，這部分我會寫出對應的代碼兆沙。用的數(shù)據(jù)集是我自己的一...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘-第二期-三陰性乳腺癌（TNBC）
文章來源：生信技能樹原文：GEO數(shù)據(jù)挖掘-第二期-三陰性乳腺癌（TNBC）這個數(shù)據(jù)集一共有三篇文章對他進行了數(shù)據(jù)挖掘： PMID: 25208879 PMID: 269213...
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【轉(zhuǎn)錄組】文庫數(shù)據(jù)標準化方法RPKM FPKM TPM CPM RPM（理論篇）文庫標準化的目的 RNA-seq每個基因的長度和深度均不相同，所以需要對基因的長度和測序深度進行Normalize 輸入 一個Read Count的數(shù)據(jù)矩陣（行為基因莉掂，列為樣...
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標準化方法表達矩陣標準化是差異分析的第一步葛圃，關于為什么需要標準化及常用的標準化的方法有哪些的一篇筆記。 參考文章 為什么需要標準化憎妙？ 轉(zhuǎn)錄組測序采取的打斷基因序列獲得基因測序的片段库正，再...