現(xiàn)在都是流行追熱點(diǎn)肄鸽，例如m6A這個(gè)研究熱點(diǎn)，很多人利用它發(fā)了n篇純生信數(shù)據(jù)挖掘的文章拷获；再比如鐵死亡這個(gè)研究熱點(diǎn)悬赏，有一大堆純數(shù)據(jù)挖掘的文章正在投稿中巷折；現(xiàn)在我們看看這個(gè)已經(jīng)發(fā)了無(wú)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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抓住一個(gè)熱點(diǎn)完沪，可以發(fā)無(wú)數(shù)篇純生信SCI
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學(xué)習(xí)筆記——投資就是時(shí)間上的平衡消費(fèi)
今天講經(jīng)濟(jì)學(xué)怎么看待投資和消費(fèi)之間的關(guān)系淘钟。 你覺得投資和消費(fèi)兩者之間，投資就是投資辅肾，消費(fèi)就是消費(fèi)队萤，這不是很清楚么？我問(wèn)你矫钓，今天中午吃盒飯要尔，這是投資還是消費(fèi)？吃飯當(dāng)然是消費(fèi)份汗，但...
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GSEA富集分子下游通路 一
GSEA下載 進(jìn)入下載頁(yè)面盈电，首先需要注冊(cè)郵箱蝴簇，然后按照電腦系統(tǒng)要求點(diǎn)擊下載就Ok了杯活。鏈接如下： https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downlo...
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推薦這本新辦的雜志起點(diǎn)8分，預(yù)計(jì)2020年發(fā)文量過(guò)千熬词，影響因子繼續(xù)8分旁钧！雜志概要 今天要介紹的期刊是cancer immunology research，創(chuàng)刊于2013年互拾，同Clinical Cancer Research歪今、Cancer Rese...
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單細(xì)胞問(wèn)題匯總入門必讀：http://www.reibang.com/p/85e2e38df673 Q1:有的群2個(gè)或者3個(gè)不同細(xì)胞類型marker高表達(dá)，這時(shí)候如何給群定義具體哪種細(xì)胞...
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拿到基因表達(dá)矩陣之后的那點(diǎn)事(一)做轉(zhuǎn)錄組一般拿到基因表達(dá)矩陣之后工作即可開始做差異分析颜矿，在此之前還有一步就是對(duì)矩陣做標(biāo)準(zhǔn)化寄猩，常見的幾種RPKM、FPKM骑疆、TMM等田篇，雖然RPKM、FPKM方法被吐槽的尤為厲害...
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TCGA+biomarker——Nomogram列線圖
列線圖簡(jiǎn)介 列線圖（Alignment Diagram）箍铭，又稱諾莫圖（Nomogram圖）泊柬，它是建立在多因素回歸分析的基礎(chǔ)上，將多個(gè)預(yù)測(cè)指標(biāo)進(jìn)行整合诈火，然后采用帶有刻度的線段兽赁，...
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count normalization的代碼
在前面的count normalization的方法部分，我初步介紹了一些常見的count normalization的方法，這部分我會(huì)寫出對(duì)應(yīng)的代碼刀崖。用的數(shù)據(jù)集是我自己的一...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘-第二期-三陰性乳腺癌（TNBC）
文章來(lái)源：生信技能樹原文：GEO數(shù)據(jù)挖掘-第二期-三陰性乳腺癌（TNBC）這個(gè)數(shù)據(jù)集一共有三篇文章對(duì)他進(jìn)行了數(shù)據(jù)挖掘： PMID: 25208879 PMID: 269213...
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【轉(zhuǎn)錄組】文庫(kù)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化方法RPKM FPKM TPM CPM RPM（理論篇）文庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化的目的 RNA-seq每個(gè)基因的長(zhǎng)度和深度均不相同惊科，所以需要對(duì)基因的長(zhǎng)度和測(cè)序深度進(jìn)行Normalize 輸入 一個(gè)Read Count的數(shù)據(jù)矩陣（行為基因，列為樣...
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標(biāo)準(zhǔn)化方法表達(dá)矩陣標(biāo)準(zhǔn)化是差異分析的第一步亮钦，關(guān)于為什么需要標(biāo)準(zhǔn)化及常用的標(biāo)準(zhǔn)化的方法有哪些的一篇筆記译断。 參考文章 為什么需要標(biāo)準(zhǔn)化？ 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序采取的打斷基因序列獲得基因測(cè)序的片段或悲，再...