
該R包由國外友人Enblacar完成,目前處于預(yù)印本階段谁撼,旨在提供一種簡化的方式,為已知的單細(xì)胞可視化生成可發(fā)布的圖形厉碟。與“審美愉悅”一詞一樣主觀喊巍,這是一組跨不同情節(jié)類型實施...
批次效應(yīng) 批次效應(yīng)是測量結(jié)果中的一部分玄糟,它們因為實驗條件的不同而具有不同的表現(xiàn)形式袄秩,并且與我們研究的變量沒有關(guān)系。不同平臺的數(shù)據(jù)之剧,同一平臺的不同時期的數(shù)據(jù)郭卫,同一個樣品不同試劑...
安裝包 使用內(nèi)置數(shù)據(jù) 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚類的情況 校正批次效應(yīng),model可以有也可以沒有贰军,如果有,也就是告訴combat,有...
差異表達(dá)分析內(nèi)容:? 基因表達(dá)量的標(biāo)準(zhǔn)化方法及可視化? counts俯树,RPKM贰盗,F(xiàn)PKM,TPM? PCA圖舵盈、熱圖等? 差異表達(dá)分析及可視化? limma-voom陋率,edge...
在我之前的帖子單細(xì)胞分析實錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類型注釋里面拗小,我已經(jīng)介紹了如何使用SingleR給單細(xì)胞數(shù)據(jù)做注釋,當(dāng)時只講了SingleR配套的參考集樱哼。這次就講講如...