
該R包由國外友人Enblacar完成滤祖,目前處于預(yù)印本階段君仆,旨在提供一種簡化的方式隧魄,為已知的單細(xì)胞可視化生成可發(fā)布的圖形藻糖。與“審美愉悅”一詞一樣主觀茫孔,這是一組跨不同情節(jié)類型實(shí)施...
批次效應(yīng) 批次效應(yīng)是測(cè)量結(jié)果中的一部分叮喳,它們因?yàn)閷?shí)驗(yàn)條件的不同而具有不同的表現(xiàn)形式,并且與我們研究的變量沒有關(guān)系缰贝。不同平臺(tái)的數(shù)據(jù)馍悟,同一平臺(tái)的不同時(shí)期的數(shù)據(jù),同一個(gè)樣品不同試劑...
安裝包 使用內(nèi)置數(shù)據(jù) 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚類的情況 校正批次效應(yīng),model可以有也可以沒有剩晴,如果有锣咒,也就是告訴combat,有...
差異表達(dá)分析內(nèi)容:? 基因表達(dá)量的標(biāo)準(zhǔn)化方法及可視化? counts赞弥,RPKM毅整,F(xiàn)PKM,TPM? PCA圖嗤攻、熱圖等? 差異表達(dá)分析及可視化? limma-voom毛嫉,edge...
在我之前的帖子單細(xì)胞分析實(shí)錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類型注釋里面,我已經(jīng)介紹了如何使用SingleR給單細(xì)胞數(shù)據(jù)做注釋白群,當(dāng)時(shí)只講了SingleR配套的參考集尚胞。這次就講講如...