load("TCGA-CHOL_gdc.Rdata")
load的這幾個(gè)沒有垦江，演示不了啊。箫老。流译。
3大差異分析r包：DESeq2逞怨、edgeR和limma做差異分析需要的數(shù)據(jù)：表達(dá)矩陣和分組信息TCGA的數(shù)據(jù)只要表達(dá)矩陣就夠了，因?yàn)槠銽CGA的樣本ID比較特殊福澡，樣本ID的第14和15位是>=10還是<10就代表了這個(gè)樣本是正常...
load("tcga-kirc-raw.Rdata")
load("DEG.Rdata")
source("3-plotfunction.R")
老師革砸，這三個(gè)怎么來的俺恪？
實(shí)戰(zhàn)：TCGA數(shù)據(jù)差異分析三大R包及其結(jié)果對(duì)比原本還有第四個(gè)部分算利，小潔老師講了另一個(gè)R包下載表達(dá)矩陣和臨床信息的册踩，TCGA-4.使用RTCGA包獲取數(shù)據(jù)但是這個(gè)包有個(gè)缺點(diǎn)就是數(shù)據(jù)更新不及時(shí)，因此當(dāng)時(shí)看到時(shí)候我就沒有跟學(xué)了...
學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)
3大差異分析r包：DESeq2、edgeR和limma做差異分析需要的數(shù)據(jù)：表達(dá)矩陣和分組信息TCGA的數(shù)據(jù)只要表達(dá)矩陣就夠了缎患，因?yàn)槠銽CGA的樣本ID比較特殊慕的，樣本ID的第14和15位是>=10還是<10就代表了這個(gè)樣本是正常...
