240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • 單細(xì)胞多樣本整合(同批次)

    單細(xì)胞前期工作重要的是如何將測(cè)序得到的多樣本整合同步分析: library(Seurat) folders=list.files('./') #...

  • 單細(xì)胞imputation數(shù)據(jù)補(bǔ)全之KNN-smoothing

    單細(xì)胞測(cè)序面臨的一個(gè)不可忽視的技術(shù)問題撑碴,就是dropout事件(表達(dá)大量的0值撑教,表達(dá)矩陣比較稀疏),如何克服這些噪聲醉拓,研究者開發(fā)了一些方法伟姐,用以...

  • RNA-seq 轉(zhuǎn)錄組批次效應(yīng)校正 combat代碼

    在合并分析不同來源或不同數(shù)據(jù)集的時(shí)候,需要做一個(gè)合并前的批次校正亿卤,在校正前后愤兵,可用PCA聚類查看批次校正的效果,以評(píng)估校正的可靠性排吴。 這里我們用...

  • 單細(xì)胞數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化

    我們?cè)诘玫絾渭?xì)胞數(shù)據(jù)raw count以后秆乳,需要對(duì)單細(xì)胞進(jìn)行一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化處理,然后再進(jìn)行下游分析钻哩。 在scRNA-seq中矫夷,由于每個(gè)細(xì)胞的起始轉(zhuǎn)錄...

  • 好記性不如爛筆頭

    非常久沒有做學(xué)習(xí)筆記的分享了,其實(shí)自己一直有在用印象筆記做學(xué)習(xí)記錄憋槐,但是一般都記錄地比較瑣碎双藕,畢竟是自己看得懂就行。所以很多筆記都不夠系統(tǒng)阳仔,因此...

  • 阿里云國(guó)外服務(wù)器處理轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)RNA-seq

    #美國(guó)弗吉尼亞 8核64G忧陪,高主頻型 4.5rmb/h 新建用戶 adduser wuxiaobin passwd wuxiaobin 賦予ro...

  • GWAS

    GWAS原理加實(shí)例操作 https://www.cnblogs.com/leezx/p/9013615.html

  • 向下取樣 under sampling

    可以實(shí)現(xiàn)實(shí)現(xiàn)子樣本生成和子樣本選取。 子樣本生成:生成的數(shù)據(jù)子集小且不屬于原數(shù)據(jù)集 子樣本選冉丁:生成的數(shù)據(jù)子集小且屬于原數(shù)據(jù)集 from imb...

  • homer安裝和使用

    介紹 安裝 1.下載homer文件 網(wǎng)址:http://homer.ucsd.edu/homer/download.html 下載其中名為con...

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