Snippy****基因組分析軟件環(huán)境搭建及使用 官方文檔:https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tse...
Snippy****基因組分析軟件環(huán)境搭建及使用 官方文檔:https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tse...
接著上一個視屏講,很多人說代碼的輸出結(jié)果看不懂,今天詳細聊一下 今天選擇了11個沙門菌進行聚類分析,最終構(gòu)建進化樹 聚類(Cluster)分析顧名思義就是指將研究的對象進行分...
一些己、系統(tǒng)發(fā)育樹的基本情況 系統(tǒng)發(fā)生樹(Phylogenetic tree),一般也叫系統(tǒng)進化樹或簡稱進化樹,可基于分子進化的假設(shè)枝恋,基于特定的算法,構(gòu)建展示一定的樹狀分支圖形來...
學(xué)習(xí)生物信息嗡害,走近生物信息學(xué)~ 生物信息學(xué)是一門跨學(xué)科研究領(lǐng)域焚碌,將計算機科學(xué)、統(tǒng)計學(xué)和數(shù)學(xué)結(jié)合霸妹,通過計算技術(shù)和算法分析生物數(shù)據(jù)十电,研究生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、功能,預(yù)測生物過程鹃骂,探索新...
個人進行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]台盯,主要是可以一次批量完成。準備工作:1.待分析的序列文件(fa...
感覺conda很好用畏线,就是我自己經(jīng)常遇到服務(wù)器連不上外網(wǎng)裝不上軟件的情況静盅,這時候用conda將軟件裝在自己電腦上,打包再傳到服務(wù)器上去用就成為我的一個小方法寝殴。首先先安裝con...
最近寫了一個snakemake流程蒿叠,方便自己跑SNP分析。目前還是需要手動編輯一個文件表蚣常,剩下就是直接等著收樹文件了栈虚。 安裝 首先克隆git clone https://gi...
BLAST的大名對于做生物的同學(xué)可以說是如雷貫耳熔酷,哪怕非生信的同學(xué)也或多或少接觸過這個東西孤紧。我們通常會使用ncbi的blast在線工具進行比對,但具有一個缺點就是很慢拒秘,因此我...