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DimPlot散點圖解決顏色疊加問題問題： 有時候拿到的樣本的UMAP圖形如下：灰色的細胞點多于紫色的細胞點，顯示的結(jié)果都是都一個樣本的細胞 針對以上問題DimPlot有個參數(shù)：s...
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單細胞細胞定義單細胞細胞定義合集 對于單細胞數(shù)據(jù)細胞分群的定義愁茁，一直是困惑大家的工作。對一直從事單細胞數(shù)據(jù)分析的工作人員多艇，細胞定義非常簡單；但是新手小白來說還...
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利用ggplot2繪制SCI樣式的UMAP圖Seurat包展示出來的umap/tsne圖都是帶有橫縱坐標著蟹，基于Seurat包可能比較難調(diào)整圖片的樣式墩蔓，只能借助AI或者PS處理圖片。這次借助...
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單細胞SRR數(shù)據(jù)拆分
10X單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fastq fastq-dump SRA轉(zhuǎn)fastq 參考鏈接：10X單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的 SRA轉(zhuǎn)fa...
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ggplot2 金字塔圖形（雙向柱狀圖）這篇文章主要是分享一下金字塔圖形的繪制方法萧豆，其來源是文章中的圖E奸披，如下： 看了一下，可以通過ggplot2來實現(xiàn)涮雷，數(shù)據(jù)來自于自己試驗的數(shù)據(jù)（該數(shù)...
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Shell腳本循環(huán)讀取文件內(nèi)容,文件列表和配置文件
1阵面、使用for循環(huán) -文件內(nèi)容 or 2、使用for循環(huán) -文件名稱 or 3.使用while循環(huán) -文件名稱 4.使用source循環(huán) 讀取配...
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R-如何在圖表左側(cè)的pheatmap中顯示行名洪鸭？問題 我正在使用R中的pheatmap包制作熱圖样刷。默認情況下，行名顯示在熱圖的右側(cè)览爵。有誰知道如何將它們移到左側(cè)置鼻？ 其他一些軟件包似乎對此具有功能...
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FASTA和FASTQ
FASTA FASTA文件主要由兩個部分構(gòu)成：序列頭信息（有時包括一些其它的描述信息）和具體的序列數(shù)據(jù)。頭信息獨占一行蜓竹，以大于號（>）開頭作為識...
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CellRanger網(wǎng)頁報告淺藍色部分下面的內(nèi)容是從10X cellranger 官網(wǎng)里面看到的關于cellranger3.0以后的版本網(wǎng)頁報告中的淺藍色部分如何計算得到的講解箕母。 C...