發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：新澤西州
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一行代碼合并多個(gè)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
寫了個(gè)簡(jiǎn)單的程序用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的和整合磅废，包含的合并方法有以下幾種：1.CCA（基于Seurat）2.Harmony3.FastMNN（基于b...
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EX-ST 膨脹的空間轉(zhuǎn)錄組最近Nature Method 發(fā)表了一篇很有意思的文章，講述了一個(gè)基于Visium改進(jìn)型的空間轉(zhuǎn)錄組戒突，文章借用了Mechanical expa...
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空間轉(zhuǎn)錄組---特斯拉 TESLAforST
這里的特斯拉不是電動(dòng)車氯迂，是一個(gè)最近（May 17践叠，2023）發(fā)表在Cell Systems 上的一個(gè)用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的工具。TESLA (...
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CellDancer細(xì)胞不會(huì)跳舞我不知道嚼蚀，但似乎nature biotech的文章代碼會(huì)有毒禁灼。。轿曙。 CellDancer是最新發(fā)表在nature biotechno...
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科技已經(jīng)被智子鎖死nature 于2023 年年初發(fā)表了一篇文章弄捕，該文章評(píng)估了一下過(guò)去50年來(lái)科研文章的創(chuàng)新性。文章使用了一個(gè)叫做CD index 的打分系統(tǒng)：T...
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智能繃帶Nature Biotechnology 發(fā)了一篇無(wú)線智能繃帶的文章导帝，很有意思守谓。萬(wàn)物既可以智能化啊。其設(shè)計(jì)是在電路板上加入了若干感應(yīng)器您单，將其貼于...
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為什么CytoTRACE會(huì)失效斋荞？CytoTRACE是 2020 年發(fā)表在Science 上的一個(gè)trajectory 推斷工具，其原理是基于一個(gè)經(jīng)驗(yàn)性的觀察睹限，即基因表達(dá)數(shù)目和發(fā)...
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無(wú)知者無(wú)畏
最近在做一個(gè)SCENIC 下游的分析譬猫，看到了一個(gè)叫CSI（Connection specificity index）的東西，大概的原理就是利用A...
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CellRank
---我不生產(chǎn)代碼羡疗，我只是個(gè)代碼的搬運(yùn)工染服。 今天來(lái)盤盤這個(gè)新工具，這個(gè)工具的一大優(yōu)點(diǎn)就是在有或者沒(méi)有splicing數(shù)據(jù)的時(shí)候叨恨，都可以用柳刮，效果如...