發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：香港
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2019-08-29內(nèi)容
基因組拼接 基因組Survey：基因組大小、雜合度、重復(fù)序列含量評(píng)估 拼接策略制定：二代、三代蔚润、Hi-C等 拼接原理 拼接軟件：SOAPdeno...
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STAMP
STAMP是對(duì)兩組或多組樣本在任何分類水平進(jìn)行顯著性差異分析的軟件包，包括物種和功能差異分析。 兩組分析時(shí)璃吧，統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)（Statistical t...
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K-mer分析常用工具
JELLYFISH KmerGenie GCE
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Teosinte ligule allele narrows plant architecture and enhances high-density maize yieldsTeosinte ligule等位基因縮小植物結(jié)構(gòu)并增強(qiáng)高密度玉米產(chǎn)量 減少空間，但玉米產(chǎn)量更高废境。為了滿足日益增長(zhǎng)的食品需求畜挨，現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的種植日益...
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NG-meta-profiler
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-infoNG-meta-pro...
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prefetch 使用
sra數(shù)據(jù)會(huì)下載到家目錄下的ncbi/public/sra中，perfetch 默認(rèn)aspera下載（如果存在于環(huán)境變量噩凹，否則使用https下載...
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Python處理fa文件的1/N種嘗試
Part1 ：計(jì)算fasta的序列的長(zhǎng)度建立一個(gè)測(cè)試文件 注意點(diǎn)：line.rstrip() 去掉換行吧符巴元，因?yàn)椴蝗サ魮Q行符，在文本文件里驮宴，換行...
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列表
目的：降低對(duì)AKW SED GREP的依賴定義列表是包含有索引的元素集逮刨，元素可由字符、數(shù)字堵泽、字符串及子列表組成修己，用 list = []表示恢总。 基...
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列表 元組
列表 定義：列表是包含有索引的元素集，元素可由字符睬愤、數(shù)字片仿、字符串及子列表組成，用 list = []表示尤辱。 元組 定義： 元組類似列表砂豌，只是元組...