https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-info
NG-meta-profiler哭廉,一個(gè)用于宏基因組的快速分析器宪巨,它執(zhí)行序列預(yù)處理镜撩,比對至附帶的數(shù)據(jù)庫,過濾比對結(jié)果和分析(物種和功能)讲婚。它明顯快于MOCAT2或htseq-count(因?yàn)樗⒃贜GLess上)另锋,其結(jié)果完全可重復(fù)。
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流程整理了人類腸道狈惫、海洋睛蛛、老鼠、豬和狗的參考基因集胧谈,基因數(shù)量從1百多萬到4千多萬不等忆肾。
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包括并行計(jì)算管理parallel,mocat宏基因組分析流程第岖、specl物種組成分析难菌、motu物種組成分析,minimap2比對工具等蔑滓。