發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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2022-01-10
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SNP過(guò)濾時(shí)常用參數(shù)的解析（群體遺傳）關(guān)于為何要進(jìn)行SNP的過(guò)濾： 第一，低質(zhì)量和無(wú)信息的SNP會(huì)影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果，甚至影響后續(xù)對(duì)生物學(xué)問(wèn)題的解釋?zhuān)坏诙后w研究...
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三種方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 學(xué)習(xí)筆記
所用數(shù)據(jù)為一個(gè)屬內(nèi)不同種不同群體的葉綠體基因組序列，數(shù)量為80條筑凫。 發(fā)現(xiàn)用全長(zhǎng)序列建樹(shù)的時(shí)候，不適合選用太多外類(lèi)群，否則ML法中會(huì)導(dǎo)致屬內(nèi)分枝的...
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WES全外顯子分析-生信技能樹(shù)
下載測(cè)試數(shù)據(jù)
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Shell十三問(wèn) 學(xué)習(xí)筆記
文本處理 Shell腳本編程 Shell 十三問(wèn) 學(xué)習(xí)筆記 shell and Carriage 關(guān)系 Shell會(huì)依據(jù)IFS(Internal...
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R語(yǔ)言學(xué)習(xí)
1基本命令 2 外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入導(dǎo)出 3 中級(jí)變量操作 4 熱圖 5 選取差異明顯的基因的表達(dá)量矩陣?yán)L熱圖 6 id轉(zhuǎn)換 7和8 9 表達(dá)矩陣的樣本...
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RNA-seq胖笛，生信技能樹(shù)
sra文件地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/ 下載測(cè)序...
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juicer 學(xué)習(xí)首先下載juicer后网持，另建一個(gè)juicer-work的文件夾，juicer-work里面各個(gè)文件夾的位置要放對(duì)长踊，reference, fast...
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如何做Genome survey功舀，2018.11.8網(wǎng)上有很多其他做survey的教程，有的還很詳細(xì)身弊，但大多都很老了辟汰，感覺(jué)對(duì)現(xiàn)在來(lái)說(shuō)并不適用，所以總結(jié)出我覺(jué)得現(xiàn)在比較好的一個(gè)方法吧阱佛。 總共只需兩個(gè)...