云養(yǎng)江停

PSMC軟件分析群體歷史有效群體大小流程 1 文件轉(zhuǎn)換 基因組文件格式為.bam笛丙，callsnp之后，再轉(zhuǎn)換為.fq.gz格式才能做為PSMC輸入文件 bcftools mp...

xiaoguolaile

對(duì)基因組測(cè)序完成后突琳，我們經(jīng)常需要統(tǒng)計(jì)測(cè)序深度（depth）和對(duì)基因組的覆蓋率（coverage） 這兩個(gè)概念有時(shí)候不太好區(qū)分若债，有時(shí)coverage也表示測(cè)序深度x. 我們用s...

xiaoji_hb

vcf文件儲(chǔ)存的是樣本的變異信息文件蠢琳，在同一批次分析中，如果不是采用joint calling的方式進(jìn)行分析镜豹，最終會(huì)獲得單個(gè)樣本的變異數(shù)據(jù)傲须。這種文件很難對(duì)同組不同樣本進(jìn)行差異...

董八七

安裝ggtree，library時(shí)報(bào)錯(cuò)'namespace:rvcheck'沒(méi)有出口‘get_aes_var’這個(gè)對(duì)象趟脂。原因是版本問(wèn)題泰讽，新的版本修改了ggtree需要的一些函...

lakeseafly

接著上一次內(nèi)容繼續(xù)介紹已卸，BBTools、BBMap中的一些實(shí)用的小工具硼一。 BBMap Read Merger 合并雙末端（PE）reads,在預(yù)期中這些reads有重疊的位置...