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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-3：CellChat常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]：是公開(kāi)的人工校正的，儲(chǔ)存受體缕坎、配體以及兩種相互作用...
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16S從實(shí)驗(yàn)到數(shù)據(jù)分析最全流程文中會(huì)對(duì)遇到的問(wèn)題進(jìn)行解答怖侦，圖表部分也做了比較詳細(xì)的說(shuō)明篡悟，對(duì)初學(xué)者比較友好谜叹，當(dāng)然知道實(shí)驗(yàn)部分會(huì)讓你對(duì)數(shù)據(jù)如何得來(lái)的有一個(gè)整體的把握，知其然而知其所以然搬葬，分析和解釋數(shù)據(jù)起來(lái)會(huì)更...
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做好當(dāng)下的事情
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qiime2R包整合qiime2和R可視化分析16s數(shù)據(jù)
背景：qiime artifact 是用于存儲(chǔ)qiime2的輸入輸出以及相關(guān)的元數(shù)據(jù)急凰，并提供結(jié)果是如何產(chǎn)生的信息女仰，但是qiime2所產(chǎn)生的artifacts（如.qza，雖然...
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RNA-seq學(xué)習(xí)：No.12 EnhancedVolcano繪制美觀火山圖EnhancedVolcano包可根據(jù)差異分析結(jié)果抡锈，基于ggplot2繪圖結(jié)構(gòu)疾忍，方便地繪制美觀的火山圖，下面根據(jù)自己的理解小結(jié)下基本用法床三。 官方全面的教程：https://g...
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如何下載TCGA數(shù)據(jù)/TCGA數(shù)據(jù)下載小教程1. 什么是TCGA一罩？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)？ TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個(gè)項(xiàng)目始于2005年撇簿，它旨在使用基因測(cè)序和生物信息學(xué)編目與癌...
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細(xì)胞類型鑒定--單細(xì)胞marker基因（持續(xù)修正）細(xì)胞類型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類型注釋
前面已經(jīng)講解了：?jiǎn)渭?xì)胞分析實(shí)錄(1): 認(rèn)識(shí)Cell Hashing[http://www.reibang.com/p/02b70bda5d0a]單細(xì)胞分析實(shí)錄(2): 使...
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scRNA基礎(chǔ)分析-3：鑒定細(xì)胞類型scRNA基礎(chǔ)分析-1:安裝包聂渊、導(dǎo)入數(shù)據(jù)、過(guò)濾質(zhì)控 - 簡(jiǎn)書(shū) scRNA基礎(chǔ)分析-2：降維與聚類 - 簡(jiǎn)書(shū) scRNA基礎(chǔ)分析-3：鑒定細(xì)胞類型 - 簡(jiǎn)書(shū) scRNA基...
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單細(xì)胞表達(dá)矩陣文件轉(zhuǎn)換
先附上學(xué)習(xí)連接https://mp.weixin.qq.com/s/NaZ5kz3ew2O01cFEnK8sXg這個(gè)問(wèn)題之前也遇到過(guò)四瘫，在此搬個(gè)小板凳來(lái)學(xué)習(xí)學(xué)習(xí) 數(shù)據(jù)下載 由于...
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如果你是程序員找蜜，或者有一顆喜歡寫(xiě)程序的心饼暑，喜歡分享技術(shù)干貨、項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)、程序員日常囧事等等弓叛，歡迎投稿《程序員》專題迈着。 專題主編：小彤花園 http://www.reibang.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.reibang.com/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章，但不限于技術(shù)邪码，也可以是項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)類的文章和程序員日常裕菠。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息。包括但不限于公眾號(hào)闭专、微博奴潘、微信，更不得在通過(guò)投稿后再修改文章加入推廣信息影钉。你可以將這些推廣以及個(gè)人信息放在個(gè)人主頁(yè)介紹里画髓。 3.字?jǐn)?shù)極少，段落混亂平委，大段代碼沒(méi)有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄奈虾，請(qǐng)確認(rèn)文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對(duì)優(yōu)質(zhì)作者及愛(ài)好者，開(kāi)設(shè)了官方程序員微信群廉赔，希望加入請(qǐng)發(fā)簡(jiǎn)信給主編小彤花園索取個(gè)人微信肉微，主編會(huì)將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容蜡塌，收獲知識(shí)碉纳。添加微信時(shí)備注昵稱。
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