240 發(fā)簡信
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    ClusterGVis: Heatmap+Mfuzz+GO/KEGG

    ClusterGVis是一個基因表達(dá)數(shù)據(jù)可視化的R包吴裤,由中國藥科大學(xué)Jun Zhang博士開發(fā)哨查,可以同時繪制聚類+分組表達(dá)趨勢折線圖+功能注釋的...

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    基因組重測序分析干貨

    ### 一般從測序公司拿到的下級數(shù)據(jù)有raw data究驴,或者經(jīng)過質(zhì)控之后的clean data,格式為fq阻肩。參考基因組及注釋文件gff從網(wǎng)上下載...

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    如何上傳轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)到NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫

    建議大家把數(shù)據(jù)上傳到我們自己的數(shù)據(jù)庫(http://bigd.big.ac.cn/)带欢,支持國產(chǎn)。由于我的數(shù)據(jù)太差了烤惊,還是傳到NCBI吧~ 第一步...

  • 國內(nèi)第一篇植物單細(xì)胞測序

    之前關(guān)注王佳偉在植物發(fā)育階段轉(zhuǎn)變過程中調(diào)控機(jī)制的研究洪囤,洲更在生信界也是大名頂頂,不知道他們是一個課題組的撕氧。用到的統(tǒng)計方法有:t-SNE和UMAP...

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    SOAPdenowo

    SOAPdenovo是一個新穎的適用于組裝短reads的方法,能組裝出類似人類基因組大小的de novo草圖喇完。該軟件特地設(shè)計用來組裝Illumi...

  • 一個糾結(jié)的晚上

    前天文章終于online了伦泥,本來是個好消息,卻高興不起來锦溪。因?yàn)椴皇前凑兆钚掳姹静桓袔讉€錯誤沒改過來。 9.5我把修改好的最終版本郵件發(fā)給編輯刻诊,為...

  • GO 和 KEGG 注釋之前防楷,為什么要先進(jìn)行序列比對(BLAST)?

    在進(jìn)行功能注釋和通路注釋之前则涯,我們會先將差異蛋白與合適的數(shù)據(jù)庫中的蛋白序列進(jìn)行比對复局。目的一:很多物種目前研究的程度還很有限,關(guān)于這些物種的蛋白注...

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    filled.contour繪制柵格圖

    今天幫一個同學(xué)做了幾個圖粟判,用到filled.contour這個函數(shù)亿昏,在一個有點(diǎn)傻的地方耗費(fèi)了我大量精力。最后保存作圖的時候如果保存成pdf 格式...

  • 陪小寶讀書之百年孤獨(dú)

    這本書的復(fù)雜性就跟百年孤獨(dú)這個名字一樣档礁,要把一百年的孤獨(dú)寫盡角钩,該是一部怎樣壯烈的文辭。 這是一部無關(guān)愛情的浪漫的書,每個人都在用自己的方式孤獨(dú)著...

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更多關(guān)于生信递礼,特別是統(tǒng)計遺傳學(xué)與生物信息學(xué)請關(guān)注知識星球-生信搬磚工惨险,在那里我會不定期跟大家分享一些高質(zhì)量文獻(xiàn),特別是本實(shí)驗(yàn)室發(fā)表的高水平論文脊髓,Many thanks.
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