要計(jì)算一個(gè)矩陣的奇異值分解(SVD)并得到對(duì)角矩陣 暂刘,以及正交矩陣斤斧,可以使用如 NumPy 這樣的科學(xué)計(jì)算庫(kù)。NumPy 提供了一個(gè) np.li...
Archetypal Analysis 是一種用于數(shù)據(jù)分析的技術(shù)递胧,它旨在找出數(shù)據(jù)集中的“極端類型”或“原型”(archetypes)碑韵,并將每個(gè)數(shù)...
來(lái)自:SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from s...
Matrix Market FormatMatrix Market格式是一種標(biāo)準(zhǔn)的文本文件格式,用于存儲(chǔ)和描述稀疏和稠密矩陣缎脾。在稀疏矩陣的情況下...
這里我們關(guān)注到: 這段代碼的功能是: 檢查 gene 是否已經(jīng)在 gene_count_dict[sub_prop] 字典中。如果不在遗菠,為這個(gè)基...
要使用純 PyTorch 訓(xùn)練模型联喘,而不是依賴于 PyTorch Lightning,需要手動(dòng)實(shí)現(xiàn)訓(xùn)練循環(huán)舷蒲、驗(yàn)證耸袜、測(cè)試步驟以及優(yōu)化器的配置。 準(zhǔn)...
scDataset 類 這段代碼定義了 scDataset 類牲平,它是一個(gè)用于表示單細(xì)胞數(shù)據(jù)集的 Python 類堤框。這個(gè)類繼承自 torch.ut...
要學(xué)習(xí)如何訓(xùn)練一個(gè)模型,特別是在指定的 scimilarity 項(xiàng)目中纵柿,首先需要了解項(xiàng)目的整體結(jié)構(gòu)和每個(gè)文件的作用蜈抓。以下是一個(gè)推薦的學(xué)習(xí)順序,以...