首先介紹一下megan中的blast2lca工具兜看，這里主要作用是使用NCBI-blast或diamond與NCBI-nr庫進(jìn)行比對后，將比對結(jié)果通過lca算法運(yùn)行斤吐，得到最大可...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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2022-03-18 python pandas 處理megan中blast2lca的結(jié)果統(tǒng)計(jì)
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RGI注釋CARDCARD官網(wǎng)：https://card.mcmaster.ca/[https://card.mcmaster.ca/]數(shù)據(jù)下載：https://card.mcmaster.c...
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Microbiome | PathoFact：鑒定宏基因組中毒力因子和耐藥基因
文獻(xiàn)信息：標(biāo)題：PathoFact: a pipeline for the prediction of virulence factors and antimicrobial...
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PDB文件解讀
https://blog.csdn.net/weixin_40013463/article/details/81735304[https://blog.csdn.net/we...
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生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫分類概覽 (第一版)
生物與計(jì)算機(jī)的結(jié)合讓生物進(jìn)入大數(shù)據(jù)時代胜茧，為方便管理各種生物數(shù)據(jù)粘优，科學(xué)家們開發(fā)了各式各樣的生物數(shù)據(jù)庫。了解與自己研究領(lǐng)域相關(guān)的數(shù)據(jù)庫呻顽，并加以利用可能會使研究工作得到事半功倍的效...
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周運(yùn)來廊遍，男嬉愧，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健喉前，瀟灑没酣，大方，靠譜卵迂。一段生信緣裕便，一棵技能樹。生信技能樹核心成員见咒，單細(xì)胞天地供稿人偿衰，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家论颅。
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宏基因組功能注釋（以COG為例）Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測哎垦、ORF開放閱讀框識別（Open Reading fr ame）和蛋白翻譯之后，就可以進(jìn)行功能注釋分析了恃疯。我們將基因/蛋白序列...
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水平基因轉(zhuǎn)移HGT
文獻(xiàn)代表 標(biāo)題：Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized human microbio...
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Linux中的生信軟件管理器-Bioconda
寫在前面 生物信息操作中必不可少的就是各種軟件的安裝漏设，不同于我們習(xí)以為常的Windows操作系統(tǒng)下軟件的安裝，Linux下軟件的安裝通常涉及源碼的編譯和二進(jìn)制文件的下載今妄，不同...
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## SNP功能注釋網(wǎng)站合集
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=2247484028&idx=1&sn=3073a0a1d4428...
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預(yù)測蛋白三維結(jié)構(gòu)一：模型預(yù)測 1. swissmodel預(yù)測（網(wǎng)址https://swissmodel.expasy.org/） 原理：相似的氨基酸序列對應(yīng)著相似的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)要求：找到與目標(biāo)...
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昆蟲學(xué)博士，分享實(shí)驗(yàn)Protocol奴璃、生物信息推励、科研繪圖鹤耍、中國傳統(tǒng)術(shù)數(shù)學(xué)等肉迫。
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大家好喊衫，我叫楊俊偉，現(xiàn)就讀于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)杆怕，在讀博士族购，主要從事生物信息學(xué)方面工作。<br><br>人生格言：Take pains, be perfect
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每周文獻(xiàn) 2021-12-26大家好陵珍，本周給大家分享的是12月21日發(fā)表在Nature Communications上與歐洲釀酒葡萄的起源相關(guān)的一篇文章寝杖。 文章題目：The genomes of 204 ...
