首先介紹一下megan中的blast2lca工具,這里主要作用是使用NCBI-blast或diamond與NCBI-nr庫進行比對后湾笛,將比對結(jié)果通過lca算法運行漓骚,得到最大可...
![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/11-4d7c6ca89f439111aff57b23be1c73ba.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
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文獻信息:標題:PathoFact: a pipeline for the prediction of virulence factors and antimicrobial...
生物與計算機的結(jié)合讓生物進入大數(shù)據(jù)時代蝌衔,為方便管理各種生物數(shù)據(jù),科學(xué)家們開發(fā)了各式各樣的生物數(shù)據(jù)庫蝌蹂。了解與自己研究領(lǐng)域相關(guān)的數(shù)據(jù)庫噩斟,并加以利用可能會使研究工作得到事半功倍的效...
Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測、ORF開放閱讀框識別(Open Reading fr ame)和蛋白翻譯之后孤个,就可以進行功能注釋分析了剃允。我們將基因/蛋白序列...
文獻代表 標題:Elevated rates of horizontal gene transfer in the industrialized human microbio...
寫在前面 生物信息操作中必不可少的就是各種軟件的安裝,不同于我們習以為常的Windows操作系統(tǒng)下軟件的安裝齐鲤,Linux下軟件的安裝通常涉及源碼的編譯和二進制文件的下載斥废,不同...