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代謝組學(xué) 表達(dá)量數(shù)據(jù)預(yù)處理 簡(jiǎn)介
表達(dá)量數(shù)據(jù)預(yù)處理 原始數(shù)據(jù)包含質(zhì)控樣本（quality control, QC）和檢測(cè)樣本唐责，為了更好地分析數(shù)據(jù)宦赠，需要對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行一系列的預(yù)處理蛮寂，主要包括對(duì)原始數(shù)據(jù)缺失值過濾...
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【代謝組學(xué)】代謝組學(xué)原始數(shù)據(jù)的預(yù)處理主要內(nèi)容： 1. 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理概述轧苫； 2. 主要分析軟件匯總捆交； 3. 數(shù)據(jù)預(yù)處理的方法焕蹄。 1. 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理概述 1.1數(shù)據(jù)預(yù)處理及其目的 為什么要做數(shù)據(jù)預(yù)處理：代謝組學(xué)...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料（GWAS tutorial）
前言 很多人問我有沒有關(guān)于全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）原理的書籍或者文章推薦逾雄。 其實(shí)我個(gè)人覺得，做這個(gè)分析腻脏，先從跑流程開始鸦泳，再去看原理。 為什么這么說呢永品，因?yàn)閷?duì)于初學(xué)者來說做鹰，...
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基因突變檢測(cè)之Mutect2寫在前面的話 今天是2021年1月3號(hào)，年底一番瞎忙活鼎姐，停更了好長(zhǎng)一段時(shí)間的簡(jiǎn)書钾麸。人生中有個(gè)很重要伯樂導(dǎo)師告訴我，在這個(gè)事多的工作環(huán)境下炕桨，沒人愿意看你太多的廢話饭尝。直奔重點(diǎn)才是...
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SNP calling及fst值的計(jì)算此處與云養(yǎng)江停的文章有略微差距 一.SNP calling 參照文章gvcf文件與vcf文件 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
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跟著Nature Plants學(xué)作圖：R語言ggplot2畫熱圖展示基因表達(dá)量論文 The flying spider-monkey tree fern genome provides insights into fern evolution and ...
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【表觀調(diào)控 實(shí)戰(zhàn)】四、目標(biāo)基因表達(dá)量迁酸、相關(guān)性的可視化與繪圖這里是佳奧先鱼，這一篇我們主要在IGV內(nèi)進(jìn)行可視化操作。 由于只是學(xué)習(xí)過程奸鬓，這里的數(shù)據(jù)我拿上一次跑ChIP-Seq的.bw文件作為示例焙畔。 僅做例子。 1 IGV可視化 載入：.b...
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跟著Nature Methods學(xué)畫圖：R語言畫熱圖（pheatmap）展示基因表達(dá)量在簡(jiǎn)書 土豆學(xué)生信 分享的內(nèi)容看到這篇論文 簡(jiǎn)書的鏈接是 http://www.reibang.com/p/bbf9cb13b41a[https://www.jianshu...
