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Sum of Single Effects Linear Regression (susieR)：多個因果變異位點的鑒定
使用susieR鑒定多個因果變異位點只需要兩個輸入文件，一個輸入文件是包含Zscore值的SNP位點（zscore.txt）跟衅，另一個文件是LD ...
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GWAS：plink進行meta分析
之前教程提到過Metal是可以做Meta分析忧侧，除了Metal石窑，PLINK也可以進行Meta分析。命令如下所示： 輸入文件gwas1.plink文...
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基因型比值比（genotypic odds ratio）和等位基因比值比（allelic odds ratio）的計算
基因型比值比（genotypic odds ratio）和等位基因比值比（allelic odds ratio）是兩個不同的概念蚓炬。一般而言松逊，通過...
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GWAS：表型的標準化（the normalization of phenotype）
GWAS表型的標準化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization肯夏、Z-score...
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GWAS：mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用：通過對多個表型相似的GWAS summary結果進行聯(lián)合分析经宏，發(fā)現(xiàn)更...
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Post-GWAS: single-cell disease relevance score (scDRS) 分析1、scDRS的計算原理如下所示： 圖片來源：Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enric...
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Post-GWAS：LDSC 的 Partitioned Heritability 分析
LDSC 除了可以計算基因多效性驯击、遺傳度烁兰、遺傳相關性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQz...
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本周最新文獻速遞20220522
本周最新文獻速遞20220522 一、精細解讀文獻 一 文獻題目： Single-nucleus chromatin accessibility...
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本周最新文獻速遞20220515
本周最新文獻速遞20220515 一徊都、精細解讀文獻 一 文獻題目： Multi-ancestry genetic study of type 2...