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?我們關(guān)注蛋白質(zhì)的功能,而結(jié)構(gòu)和功能聯(lián)系緊密版扩。一旦在氨基酸序列水平發(fā)現(xiàn)有趣的序列(比如一個(gè)模體(motif)或者進(jìn)化上保守的片段)废离,下一步往往就是研究這段序列的3-D結(jié)構(gòu)。(...
舉個(gè)栗子??: 最近對(duì)擬南芥中的一個(gè)叫做CBF的基因非常感興趣礁芦,現(xiàn)在我想看看這個(gè)CBF基因在一個(gè)新測(cè)序的物種Am基因組上是否存在蜻韭,Am中有幾個(gè)CBF基因?這樣的查找可以通過本地...
18年1月29日宏基因組轉(zhuǎn)載了中科院生態(tài)中心鄧曄組的文章《土壤細(xì)菌定量方法結(jié)合相對(duì)豐度分析揭示種群的真實(shí)變化》[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz...
本文我們來簡(jiǎn)單介紹一下非趁浼快捷好用的一個(gè)RNAseq工具——Kallisto活翩。Kallisto被我推薦的原因是其速度非撑牍牵快,在我的Mac Pro就可以運(yùn)行使用材泄,而且其結(jié)果也比...
參考資料 https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 全基因組關(guān)聯(lián)分析學(xué)習(xí)資料(GWAS tutorial) 論文 A tutoria...
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程,并提供了基本的命令旦事,用到的軟件包括BWA魁巩、samtools、gatk姐浮、Plink谷遂、Admixture、Tassel等卖鲤,在此分享出來...
按照前人的教程蛋逾,跑了跑GWAS流程集晚,作為初學(xué)者,歡迎大家提問区匣,指教偷拔。 數(shù)據(jù)來源:A new regulator of seed size control in Arabido...
在實(shí)驗(yàn)室中,我們經(jīng)常需要對(duì)分子生物學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析亏钩,常見的有DNA和蛋白質(zhì)分子序列比對(duì)莲绰。分子序列比對(duì)分為全局序列比對(duì)和局部序列比對(duì)兩種情況。其具體算法我們將在以后的文章中詳細(xì)介...
前言 在工業(yè)界茵瀑,天天做著重復(fù)的簡(jiǎn)單工作间驮,已失去了對(duì)領(lǐng)域新技術(shù)發(fā)展的敏感性和好奇心,對(duì)技術(shù)人員來說這是件可怕的事情马昨。因?yàn)闆]時(shí)間竞帽,也沒興趣看文獻(xiàn)扛施,不能掌握第一手資料,只能在網(wǎng)上找...
Part 1. 蛋白質(zhì)組學(xué)中屹篓,譜圖搜庫是如何實(shí)現(xiàn)的疙渣? 蛋白質(zhì)組學(xué)中,各種軟件對(duì)質(zhì)譜得到的譜圖進(jìn)行搜庫時(shí)通常是利用以下三種方法之一進(jìn)行: 根據(jù)相關(guān)的質(zhì)量信息獲得部分或完整的肽序...
官方文檔: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 準(zhǔn)備 Spectronaut軟件是蛋白組DIA...