? ? ? ? 今天解析一篇經(jīng)典的遺傳學文章。這也是遺傳定位的經(jīng)典文章蔗草。這是發(fā)表在nature genetics上面的一篇Letter兰英。雖然不是article文章寞射，但也還是具有很高的價值。
? ? ? ? 水稻落粒性狀對于農業(yè)生產具有重要影響豫柬。培育低落粒性狀的水稻品種對于農業(yè)增產具有重要促進作用愈污。在前期的研究中，科學家發(fā)現(xiàn)qSH1和sh4 影響水稻的落粒性狀轮傍。
? ? ? ? 在這篇文章中暂雹，作者發(fā)現(xiàn)，除了qSH1和sh4 影響水稻的落粒性狀创夜，這一相對性狀似乎還受到其他基因的調控杭跪。具體如下：
? ? ? ? 作者們發(fā)現(xiàn)栽培稻與野生稻在形態(tài)以及水稻主穗分支上存在巨大差異。栽培稻（日本晴）在株型上是緊湊型的驰吓，而野生稻的株型相對松散涧尿。由于野生稻的主穗具有一個bump structure,因此穗型變得不緊湊。因此選擇將栽培稻與野生稻進行雜交檬贰，以此來定位穗型調控基因姑廉。
? ? ? ? 通過雜交實驗，作者發(fā)現(xiàn)調控株型的基因定位在4號染色體上翁涤，并命名為SPR3桥言。之后構建不同的NIL（近交系）群體萌踱，作者發(fā)現(xiàn)近交系包含來自栽培稻的SPR3片段的表現(xiàn)為緊湊穗型。
? ? ? ? 進一步的實驗發(fā)現(xiàn)号阿，緊湊型的穗型相比于松散型的穗型將種子保存在穗上的時間更長并鸵。緊湊型的穗型同時也能減少花粉的外交率。對于保持種子的活力比松散型的穗型更好扔涧。
? ? ? ? 接下來园担，作者利用精細定位方法定位到OsL1就是SPR3這一QTL對應的基因。在這里枯夜，雖然作者將mapping區(qū)間縮小到9.3kb的區(qū)間弯汰，卻發(fā)現(xiàn)這9.3kb的區(qū)間并沒有一個注釋的基因。通過在這區(qū)間的上下游找注釋基因湖雹，最后才將下游的OsLG1確定為目標基因咏闪。這也告訴我們定位時一定要注意目標基因不一定在定位區(qū)間內，需要同時考慮區(qū)間以外的區(qū)間劝枣。
? ? ? ? 最后汤踏，作者通過對不同野生稻與栽培稻在這一區(qū)間的序列多態(tài)性分析，發(fā)現(xiàn)這9.3kb區(qū)間在栽培稻中收到了很強的自然選擇舔腾。
? ? ? 這是我們組會時候我匯報的文章。之所以選擇講這篇文章稳诚，一是這個定位過程和我目前做的是一樣的哗脖。二是這個定位結果出乎我的意料，目標基因居然不在mapping區(qū)間內扳还，這提醒我們定位區(qū)間不一定十分準確才避。最后，作者沒有進一步研究OsLG1的分子機理氨距，反而直接研究這個基因在進化方面的功能也給我們打開了基因研究得新思路（雖然這是常規(guī)操作桑逝，但還是打開了我的視野）。當然組會匯報都是全英文匯報俏让，老師鼓勵全英文環(huán)境楞遏。
