請問，多個(gè)屬多個(gè)物種單拷貝同源基因建樹時(shí)，保證每個(gè)單拷貝同源基因都至少60%樣本比例千劈，那串聯(lián)時(shí)讨惩，樣本里那些沒有的基因怎么辦墓阀？是直接“——————”代替嗎禾乘？
如何輕松構(gòu)建物種系統(tǒng)發(fā)育樹在常規(guī)的基因組分析中惋耙，當(dāng)我們對某一物種的基因組進(jìn)行從頭組裝與注釋獲得其的基本信息后乱陡，通常會想知道該物種與一些其他近源物種之間的進(jìn)化關(guān)系浇揩，此時(shí)就需要構(gòu)建不同物種之間的系統(tǒng)發(fā)育樹...
有沒有人知道，KeyError: 'Unknown INFO field: ANN'
這個(gè)bug怎么改啊
我的vcf沒有ANN啊
CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT sample1 sample2 sample3 ……
用snpEff產(chǎn)出的vcf提取4DTv位點(diǎn)铆铆，構(gòu)建進(jìn)化樹用snpeff產(chǎn)出的vcf提取4DTv位點(diǎn)蝶缀，用于構(gòu)建進(jìn)化樹 轉(zhuǎn)載自https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/1055...
昨天發(fā)現(xiàn)了神器multiqc來整合分析一個(gè)目錄下所有文件的quality control結(jié)果，今天來試著裝了一下税娜。 然后又發(fā)現(xiàn)了conda這個(gè)使得生活更美好的package ...
樓主坐搔，你好。
我用自己的數(shù)據(jù)snp—甲基化數(shù)據(jù)做了 MatrixEQTL敬矩，生成的圖 plot(me)很奇怪概行。不管是什么模型，都是梯形上升弧岳。不是對角線的…… 請問我這種是不是數(shù)據(jù)不是正態(tài)分布的原因凳忙？
多組學(xué)聯(lián)合分析-Matrix eQTL找到Matrix eQTL這個(gè)包，看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations（...
